54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2437 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1788  porin  92.25 
 
 		 387 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  91.73 
 
 		 387 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  91.73 
 
 		 387 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  98.97 
 
 		 387 aa  785    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  792    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  99.48 
 
 		 387 aa  789    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  91.99 
 
 		 387 aa  721    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  76.49 
 
 		 383 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  72.09 
 
 		 379 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  72.09 
 
 		 380 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  75.19 
 
 		 382 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  73.39 
 
 		 380 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  69.71 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  70 
 
 		 386 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  48.04 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  46.03 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  36.43 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  38.29 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  36.58 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  35.53 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  35.29 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  35.48 
 
 		 470 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  37.56 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  37.34 
 
 		 348 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  34.1 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  36.01 
 
 		 356 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  37.18 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  38.8 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  35.25 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  35.75 
 
 		 346 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  32.19 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  32.74 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  32.38 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  32.85 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  34.47 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  32.66 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  32.29 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  27.81 
 
 		 365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  30.73 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  28.46 
 
 		 477 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1424  hypothetical protein  25.85 
 
 		 560 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  28.95 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  27.45 
 
 		 400 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  29.8 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  26.47 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  25.45 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  24.93 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1605  hypothetical protein  24.76 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  26.37 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0526  hypothetical protein  25.61 
 
 		 635 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.710875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  24.53 
 
 		 549 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  26.12 
 
 		 572 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  28.28 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  26.83 
 
 		 569 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.174396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>