More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1801 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  62.42 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  51.71 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  51.71 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  52 
 
 		 200 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  52 
 
 		 209 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  51.98 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  52 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  46.08 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  43.84 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  43.35 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  42.99 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  46.08 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  43.84 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  43.28 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  43.28 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  43.28 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  44.88 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  45.85 
 
 		 206 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  44.98 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  42.72 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  42.16 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  47.03 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  40.69 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  41.46 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  42.29 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  43.63 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  40.69 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  43.9 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  40 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  44.87 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  40.87 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  40.98 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  42.44 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  39.71 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  40.5 
 
 		 210 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  35.86 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  38.07 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  33.5 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  33.5 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  32.26 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  47.57 
 
 		 102 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  52.94 
 
 		 91 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  28.72 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  28.57 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  31.63 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  29.68 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  26.83 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  25.91 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  25.91 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  30.2 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  28.79 
 
 		 189 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  29.68 
 
 		 196 aa  62  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  27.32 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  28.57 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  32 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  29.03 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  26.96 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  33.33 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  32.74 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  24.37 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  32.32 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  26.32 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  34.18 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  25.15 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  28.39 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  29.35 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  27.32 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  40.85 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  26.51 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  27.8 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  25.38 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  24.75 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  30.15 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  28.64 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  29 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  28.22 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.1 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  27.1 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  27.1 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  29.75 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  27.1 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  23.95 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  29 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  27.18 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  27.18 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  25.81 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  31.66 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  25.81 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>