63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1370 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 156 aa  326  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  98.72 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  96.79 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  92.95 
 
 		 156 aa  313  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  89.74 
 
 		 156 aa  297  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  87.18 
 
 		 156 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  87.18 
 
 		 156 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  87.18 
 
 		 156 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  86.54 
 
 		 156 aa  289  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  75 
 
 		 156 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  73.08 
 
 		 156 aa  248  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  63.46 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  60.65 
 
 		 159 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  55.13 
 
 		 158 aa  173  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  40.17 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  40 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  35.45 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  26.32 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  27.14 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  32.23 
 
 		 241 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  30 
 
 		 560 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  36.9 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  31.58 
 
 		 568 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  27.63 
 
 		 507 aa  47.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  28.07 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  30.48 
 
 		 232 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  26.8 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  32.74 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  25.42 
 
 		 533 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  26.98 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  26.49 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  28.28 
 
 		 438 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  28.32 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  30.84 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  47.62 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  29.13 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  35.62 
 
 		 179 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  31.53 
 
 		 241 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  29.17 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  25.81 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  29.79 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  38.64 
 
 		 243 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  28.47 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 197 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  27.82 
 
 		 565 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  30.68 
 
 		 438 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  30.63 
 
 		 241 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  27.82 
 
 		 565 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  29.63 
 
 		 430 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  30.68 
 
 		 438 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  30.63 
 
 		 241 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  30.68 
 
 		 430 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  30.63 
 
 		 241 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  27.82 
 
 		 565 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  29.63 
 
 		 430 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  31.48 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  27.08 
 
 		 550 aa  40.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>