More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1989 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  83.25 
 
 		 410 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  92.01 
 
 		 414 aa  730    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  84.58 
 
 		 422 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  84.01 
 
 		 410 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  83.21 
 
 		 410 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  94.92 
 
 		 414 aa  774    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  94.67 
 
 		 414 aa  772    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  83.12 
 
 		 410 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 414 aa  816    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  65.24 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  67.5 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  44.94 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  42.86 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  42.71 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  41.39 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  43.4 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  43.32 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.73 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  44.48 
 
 		 386 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  44.44 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  44.48 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  44.44 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  44.19 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  43.3 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  43.3 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  43.3 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  43.3 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  43.3 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  43.3 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.336287 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  43.3 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  43.27 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  30.9 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.96 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.03 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.03 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.21 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.72 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  28.49 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.31 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  30.59 
 
 		 394 aa  136  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.47 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.59 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  30.03 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.4 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  32.39 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  28.31 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  30.37 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  29.57 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.99 
 
 		 469 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.67 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.3 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.2 
 
 		 461 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.14 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.61 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.23 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  27.91 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.64 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.92 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.27 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.15 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.72 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  28.65 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.18 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.3 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.12 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.4 
 
 		 398 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.68 
 
 		 399 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  29.23 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.5 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.91 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.74 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  28.1 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  27.38 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.36 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.29 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.29 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.34 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.48 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.48 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 415 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 465 aa  116  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.48 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.48 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.17 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.93 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.48 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.48 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  26.48 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.48 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.88 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.39 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.33 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>