153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3553 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  91.79 
 
 
855 aa  1637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  92.85 
 
 
855 aa  1628    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  92.97 
 
 
855 aa  1630    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  78.84 
 
 
860 aa  1404    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  92.61 
 
 
855 aa  1626    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  75.27 
 
 
852 aa  1317    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  99.18 
 
 
854 aa  1749    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  92.51 
 
 
854 aa  1647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
854 aa  1765    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  50 
 
 
841 aa  788    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  34.2 
 
 
793 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  33.62 
 
 
795 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  33.62 
 
 
795 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  33.61 
 
 
779 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  33.83 
 
 
779 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  32.26 
 
 
824 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  33.7 
 
 
795 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  34.16 
 
 
773 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  31.55 
 
 
778 aa  386  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  32.65 
 
 
804 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  32.39 
 
 
772 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  32.39 
 
 
763 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  32.48 
 
 
779 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  32.26 
 
 
769 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  31.33 
 
 
760 aa  365  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  31.17 
 
 
762 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  31.48 
 
 
770 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  31.07 
 
 
737 aa  360  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  29.98 
 
 
819 aa  347  8e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  31.92 
 
 
814 aa  340  9e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  32.69 
 
 
773 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  32.56 
 
 
805 aa  325  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  30.83 
 
 
816 aa  321  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  29.61 
 
 
842 aa  310  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  29.56 
 
 
799 aa  294  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  28.86 
 
 
789 aa  263  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.9 
 
 
694 aa  171  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  23.37 
 
 
674 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  23.09 
 
 
708 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  23.93 
 
 
725 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  25.16 
 
 
718 aa  132  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  21.99 
 
 
712 aa  130  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.52 
 
 
724 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  20.64 
 
 
701 aa  100  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  26.58 
 
 
809 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  26.13 
 
 
809 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  24.17 
 
 
769 aa  87.8  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.68 
 
 
796 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  23.5 
 
 
821 aa  84.7  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  21.68 
 
 
761 aa  84  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.04 
 
 
827 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.85 
 
 
796 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  20.88 
 
 
796 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.85 
 
 
796 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.85 
 
 
796 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  25.84 
 
 
779 aa  80.9  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  22.15 
 
 
796 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.58 
 
 
796 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  21.83 
 
 
823 aa  79.7  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  23.93 
 
 
843 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  24.45 
 
 
818 aa  79  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  23.9 
 
 
829 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.22 
 
 
796 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  20.68 
 
 
796 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  22.98 
 
 
825 aa  79  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.95 
 
 
796 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  25.33 
 
 
810 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  22.41 
 
 
855 aa  78.2  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  22.97 
 
 
827 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  24.29 
 
 
787 aa  77  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  23.74 
 
 
770 aa  76.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  24.77 
 
 
813 aa  76.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  25.27 
 
 
812 aa  76.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.09 
 
 
854 aa  73.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  22.44 
 
 
857 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  24.81 
 
 
864 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  23.6 
 
 
821 aa  71.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  23.11 
 
 
808 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  23.92 
 
 
856 aa  68.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  25.62 
 
 
903 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  21.42 
 
 
812 aa  68.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  23.6 
 
 
782 aa  67.4  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.47 
 
 
818 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  23.14 
 
 
809 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0200  peptidase S45 penicillin amidase  21.76 
 
 
742 aa  66.6  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  22.4 
 
 
821 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  22.06 
 
 
839 aa  67  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  23.14 
 
 
809 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  21.25 
 
 
819 aa  65.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  27.24 
 
 
906 aa  64.7  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  25.32 
 
 
947 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  23.46 
 
 
847 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  23.02 
 
 
803 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  22.56 
 
 
807 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1767  Penicillin amidase  27.72 
 
 
963 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439064  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  21.57 
 
 
762 aa  63.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  23.63 
 
 
854 aa  62.4  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  23.29 
 
 
785 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  20.79 
 
 
817 aa  61.6  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  23.65 
 
 
872 aa  61.6  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>