More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2230 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2346  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  98.75 
 
 		 639 aa  1304    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.15581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2230  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 639 aa  1320    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0741233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2117  histidine kinase  97.18 
 
 		 639 aa  1257    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201889  normal  0.773102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2200  response regulator receiver protein  57.54 
 
 		 641 aa  734    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.934498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2129  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  95.4 
 
 		 652 aa  1249    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2332  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 670 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000360644  normal  0.145039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1771 aa  156  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 1643 aa  154  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 1767 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 1767 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 932 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 		 847 aa  151  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 1767 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 1002 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 1230 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 1792 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 1002 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 1784 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 1782 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 916 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.26 
 
 		 1234 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  27.11 
 
 		 1125 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 1203 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 		 1245 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  27.42 
 
 		 1765 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 		 1146 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 		 1786 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 1009 aa  144  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  25.94 
 
 		 1200 aa  143  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 		 1126 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 		 1193 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 1574 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 		 1193 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  28.88 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  25.84 
 
 		 810 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.15 
 
 		 1763 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 1013 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  29.57 
 
 		 987 aa  142  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 862 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  26.67 
 
 		 1128 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  28.53 
 
 		 1179 aa  140  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.87 
 
 		 2051 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 1016 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 		 1550 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1582 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 		 1128 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 844 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1768 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 1143 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  25.3 
 
 		 782 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  27.61 
 
 		 1177 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 		 734 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1285  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 		 1070 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102629  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 844 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 		 785 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  26.25 
 
 		 1236 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 1362 aa  138  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  24.81 
 
 		 630 aa  138  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 		 1234 aa  137  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 		 1131 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  24.81 
 
 		 630 aa  137  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  26.65 
 
 		 985 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 		 1214 aa  137  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 		 1166 aa  137  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 1323 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 721 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 827 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1130 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 		 1236 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  26.43 
 
 		 858 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 1266 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 1322 aa  135  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 		 1611 aa  135  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 1126 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.1 
 
 		 870 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 		 925 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1575  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 577 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.420465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2407  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 		 577 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1070  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 		 575 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.677044  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  27.07 
 
 		 1323 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  27.89 
 
 		 2035 aa  134  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  27.62 
 
 		 1286 aa  134  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 717 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  27.96 
 
 		 861 aa  133  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  29.09 
 
 		 1040 aa  134  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 		 1195 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  25.99 
 
 		 1188 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 1820 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1099 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 		 1236 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 		 1236 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 816 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 		 1236 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 1023 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 907 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.63 
 
 		 903 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 811 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.76 
 
 		 1058 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 		 1075 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 		 950 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>