49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27760 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  100 
 
 
442 aa  915    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  44.18 
 
 
455 aa  374  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  43.56 
 
 
453 aa  361  1e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  41.22 
 
 
445 aa  340  2e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  29.75 
 
 
437 aa  206  8e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  28.89 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  26.74 
 
 
445 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  30 
 
 
448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  30.02 
 
 
456 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  27.55 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  26.85 
 
 
450 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.88 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  26.46 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  28.78 
 
 
447 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  26.13 
 
 
449 aa  146  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.55 
 
 
443 aa  143  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.55 
 
 
443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  25.67 
 
 
435 aa  136  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  26.25 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  27.12 
 
 
456 aa  134  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  25.48 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  27.4 
 
 
464 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  26.78 
 
 
452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  25.43 
 
 
457 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  27.46 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  25.06 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  24.71 
 
 
431 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  26.06 
 
 
440 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  26.22 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  26.67 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  26.21 
 
 
437 aa  96.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  23.79 
 
 
463 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  25.59 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  25.69 
 
 
442 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  25.35 
 
 
442 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  28.85 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.12 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  26.53 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  23.61 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  23.61 
 
 
471 aa  53.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  43.33 
 
 
115 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  29.63 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  25.32 
 
 
441 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  24.33 
 
 
388 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  22.36 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  22.12 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  24.38 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.72 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  27.87 
 
 
416 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>