More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1620 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1620  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 443 aa  916    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2948  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  31.45 
 
 		 374 aa  156  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.72 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  31.72 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  31.42 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.37 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1619  extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 		 373 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 		 398 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  29.39 
 
 		 383 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 419 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.16 
 
 		 376 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 		 371 aa  117  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 		 382 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 399 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 387 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 392 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 389 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  28.62 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.55 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.26 
 
 		 399 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 		 402 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 379 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  28.2 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.93 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  25.24 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2947  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  22.72 
 
 		 511 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  25.24 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  25.24 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.76 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  25.24 
 
 		 379 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.24 
 
 		 379 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 		 383 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 		 385 aa  99.8  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  25.24 
 
 		 379 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.24 
 
 		 375 aa  99.8  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 		 380 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1695  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.02 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 		 376 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 		 379 aa  98.2  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 381 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6859  extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.32 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 		 376 aa  97.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 		 383 aa  97.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>