More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0892 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 342 aa  708    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  54.84 
 
 		 336 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  52.08 
 
 		 359 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  26.41 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  27.15 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1760  hypothetical protein  28.42 
 
 		 441 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.50844  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0792  hypothetical protein  24.49 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565262  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  23.99 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  22.99 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  22.65 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 904 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 904 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 904 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.94 
 
 		 2762 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  20.5 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30000  polyketide synthase  25.6 
 
 		 18193 aa  56.2  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  41.27 
 
 		 908 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  61.76 
 
 		 893 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  21.38 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  49.02 
 
 		 907 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 916 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 939 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 915 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 903 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  33.03 
 
 		 916 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 910 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 916 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  66.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 906 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  66.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  33.03 
 
 		 900 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 		 901 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  22.58 
 
 		 1470 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 901 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 907 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  46.94 
 
 		 955 aa  53.9  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  22.58 
 
 		 1470 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  38.89 
 
 		 909 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  22.08 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 901 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 901 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 901 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  50.94 
 
 		 907 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 901 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 909 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 920 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  68 
 
 		 909 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  56.76 
 
 		 912 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  45.1 
 
 		 907 aa  52.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 		 908 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  44.23 
 
 		 908 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 902 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 924 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 925 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 930 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  44.64 
 
 		 913 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  44.64 
 
 		 916 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  31.13 
 
 		 897 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  76 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 908 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 842 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 944 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 934 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 931 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 932 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 		 908 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 932 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 897 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 		 908 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 919 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  36.36 
 
 		 922 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 932 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 916 aa  51.6  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 917 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  42.31 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  42.31 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 		 911 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 931 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 865 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 932 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 917 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  42.31 
 
 		 908 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  52.5 
 
 		 1113 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 934 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 907 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  77.27 
 
 		 923 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 934 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  47.17 
 
 		 909 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  20.63 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 917 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 900 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  45.24 
 
 		 918 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>