156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0775 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 264 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  49.61 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  44.49 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 		 318 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  42.21 
 
 		 318 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  40.68 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  36.14 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.72 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  29.92 
 
 		 245 aa  85.5  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  30.38 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  30.3 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  28.14 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  26.79 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  25.37 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  26.32 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13201  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  31.43 
 
 		 314 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  25.67 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  27.17 
 
 		 200 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 		 309 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 348 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  23.31 
 
 		 380 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.93 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  23.6 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  26.27 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  24.44 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  23.22 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  22.6 
 
 		 347 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.91 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  26.34 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  22.81 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 504 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  24.2 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 		 347 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  21.55 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 308 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  23.68 
 
 		 275 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.76 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.19 
 
 		 343 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.66 
 
 		 312 aa  45.4  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 344 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  24.49 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.06 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  24.87 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  20.69 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  22.38 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  20.52 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  24.08 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.81 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>