151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0771 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  78.6 
 
 		 855 aa  1434    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  80 
 
 		 855 aa  1425    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  80.12 
 
 		 855 aa  1426    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  100 
 
 		 860 aa  1775    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.77 
 
 		 855 aa  1426    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  72.39 
 
 		 852 aa  1251    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  78.72 
 
 		 854 aa  1434    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  78.02 
 
 		 854 aa  1420    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  78.84 
 
 		 854 aa  1435    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  50.43 
 
 		 841 aa  803    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  33.82 
 
 		 793 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  33.17 
 
 		 824 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  34.23 
 
 		 779 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  34.28 
 
 		 779 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  34.16 
 
 		 773 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  32.72 
 
 		 772 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  31.69 
 
 		 778 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  33.09 
 
 		 763 aa  383  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  32.89 
 
 		 795 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  32.69 
 
 		 779 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  32.84 
 
 		 769 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  30.7 
 
 		 762 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  32.44 
 
 		 795 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  30.62 
 
 		 760 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  33.01 
 
 		 770 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  32.8 
 
 		 795 aa  363  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  31.73 
 
 		 804 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  30.6 
 
 		 737 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  30.89 
 
 		 819 aa  333  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  33.17 
 
 		 773 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  32.12 
 
 		 816 aa  327  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  30.66 
 
 		 814 aa  317  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  31.7 
 
 		 805 aa  314  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  31.01 
 
 		 842 aa  313  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  29.9 
 
 		 799 aa  300  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  28.43 
 
 		 789 aa  257  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  24.26 
 
 		 694 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  22.81 
 
 		 674 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  22.77 
 
 		 708 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  23.03 
 
 		 725 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.48 
 
 		 712 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  23.21 
 
 		 718 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22 
 
 		 701 aa  111  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  26.74 
 
 		 809 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  20.96 
 
 		 724 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  22.86 
 
 		 761 aa  101  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  26.8 
 
 		 809 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.66 
 
 		 796 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  24.18 
 
 		 808 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  22.39 
 
 		 843 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  24.66 
 
 		 769 aa  88.6  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  21.78 
 
 		 796 aa  88.2  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.96 
 
 		 796 aa  87.8  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.96 
 
 		 796 aa  87.8  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  23.23 
 
 		 855 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.22 
 
 		 796 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.51 
 
 		 796 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  21.78 
 
 		 796 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.78 
 
 		 796 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  24.93 
 
 		 818 aa  84.7  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  22.55 
 
 		 804 aa  84.7  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  22.39 
 
 		 857 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  24.19 
 
 		 825 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  23.05 
 
 		 821 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.88 
 
 		 796 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  23.37 
 
 		 827 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  22.77 
 
 		 854 aa  81.3  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  24.06 
 
 		 787 aa  81.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  24.66 
 
 		 813 aa  81.3  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.27 
 
 		 796 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0200  peptidase S45 penicillin amidase  22.87 
 
 		 742 aa  80.5  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  23.44 
 
 		 770 aa  79.7  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  24.04 
 
 		 821 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.4 
 
 		 818 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  23.33 
 
 		 829 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  25.89 
 
 		 854 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  22.93 
 
 		 827 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  25.06 
 
 		 779 aa  75.1  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  24.8 
 
 		 947 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  22.38 
 
 		 803 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5851  peptidase S45 penicillin amidase  23.99 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390713  normal  0.0954334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  21.1 
 
 		 817 aa  72.4  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  24.04 
 
 		 947 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  22.65 
 
 		 947 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  24.73 
 
 		 810 aa  70.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  24.03 
 
 		 812 aa  69.7  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  23.79 
 
 		 812 aa  68.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  27.15 
 
 		 906 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  24.62 
 
 		 864 aa  67.8  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  23.83 
 
 		 856 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  27.1 
 
 		 819 aa  66.6  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1767  Penicillin amidase  30.08 
 
 		 963 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439064  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  21.04 
 
 		 819 aa  66.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  21.95 
 
 		 823 aa  66.6  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  21.52 
 
 		 738 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  29.1 
 
 		 903 aa  65.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  21.35 
 
 		 821 aa  63.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  23.39 
 
 		 783 aa  63.9  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  22.39 
 
 		 807 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  24.29 
 
 		 858 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>