More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0743 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  80.67 
 
 		 389 aa  663    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  100 
 
 		 389 aa  808    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  58.61 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  58.1 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  58.61 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  57.62 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  56.85 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  56.96 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  55.53 
 
 		 395 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  55.53 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  56.7 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  55.81 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  55.93 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  56.99 
 
 		 401 aa  434  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  55.84 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  56.33 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  54.36 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  55.24 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  56.07 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  56.19 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  55.93 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  55.21 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  54.52 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  53.85 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  53.85 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  53.85 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  51.41 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  53.08 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  51.29 
 
 		 401 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  49.75 
 
 		 406 aa  371  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  49.87 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  48.71 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  48.45 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  48.71 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  50.52 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  46.63 
 
 		 458 aa  325  8.000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  46.84 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  43.4 
 
 		 466 aa  293  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  53.81 
 
 		 234 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.46 
 
 		 417 aa  205  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  32.89 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  34.65 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  34.65 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.41 
 
 		 413 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  35.71 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  34.48 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.77 
 
 		 392 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  34.9 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.89 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  34 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  34.3 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  34.41 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.03 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  31.94 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  32.55 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.8 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  32.7 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  29.66 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  32.93 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.03 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  31.68 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.41 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  31.19 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.74 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.14 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  32.84 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  31.32 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.51 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.83 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.51 
 
 		 392 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.5 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.64 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  33.33 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  29.9 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.16 
 
 		 388 aa  152  7e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33 
 
 		 399 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.61 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  32.76 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  31.2 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  32.76 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  31.2 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  29.65 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  32.45 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  29.9 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  32.45 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  32.45 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  33.89 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.36 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  33.89 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  30.67 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  30.93 
 
 		 380 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  32.75 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.58 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.99 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  30.46 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.09 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  30.65 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  29.09 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.67 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>