More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0385 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  74.49 
 
 		 294 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  63.14 
 
 		 294 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  63.82 
 
 		 294 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  63.14 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.14 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  63.32 
 
 		 306 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  62.63 
 
 		 306 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  62.98 
 
 		 306 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  62.98 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  64.62 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  62.41 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  56.37 
 
 		 290 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  58.96 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  34.6 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  41.26 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  41.26 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  35.94 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  36.24 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  36.33 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  34.27 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  31.62 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  34.48 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  29.14 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  28.78 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  28.42 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  31.47 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  28.06 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  28.83 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  27.7 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  27.7 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.12 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  27.66 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  30.13 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  28.76 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.66 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  24 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.27 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  28.9 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  28.91 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  30.05 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  27.34 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  26.85 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  24.83 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  27.5 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  26.72 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  27.51 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  27.4 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  28.29 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  27.42 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  24.82 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  27.76 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.32 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  29.86 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.62 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  26.88 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  26.88 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  30.05 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  25.9 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  26.69 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  26.39 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  28.06 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.4 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  27.73 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  22.53 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.77 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  28.93 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  27.78 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.04 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  25.11 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  27.68 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.2 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  23.44 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.3 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  27.01 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  32.12 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  27.4 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  29.95 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  25.42 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  26.75 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.05 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.05 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.05 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  28.29 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  25.42 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  24.49 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  26.2 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  26.24 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  27.01 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  26.24 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  27.87 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  27.96 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>