80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2269 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  100 
 
 		 116 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  95.69 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  74.14 
 
 		 116 aa  184  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  54.24 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  44.83 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  46.96 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  59.7 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  41.53 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  48.05 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  38.53 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  36.52 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  35.65 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  35.66 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  35.34 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  38.02 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  38.14 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  51.85 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  32.26 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  50.79 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  32.74 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4314  HNH endonuclease  34.82 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0932405  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3875  HNH endonuclease  34.82 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3802  HNH endonuclease  34.82 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142471  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  32.31 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  55.56 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  30.99 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2241  HNH endonuclease  37.97 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  35.48 
 
 		 585 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  37.65 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  41.54 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  29.89 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  40 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  31.62 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  36.36 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 552 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2101  HNH nuclease  50 
 
 		 576 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  41.67 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  37.68 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3259  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  35.56 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  34.88 
 
 		 132 aa  42  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 168 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2249  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2895  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 174 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  38.33 
 
 		 560 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 459 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  41.54 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  44.93 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  36.21 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  36.21 
 
 		 168 aa  40.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  37.93 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 185 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>