More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1709 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1564  DNA-binding transcriptional repressor MalI  99.49 
 
 		 342 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.253156 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1709  maltose regulon regulatory protein MalI  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.616264  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  80.1 
 
 		 342 aa  345  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  80.1 
 
 		 342 aa  345  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  80.1 
 
 		 342 aa  345  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  80.1 
 
 		 342 aa  345  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  80.1 
 
 		 342 aa  345  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  80.1 
 
 		 342 aa  345  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  80.1 
 
 		 342 aa  345  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  80.1 
 
 		 342 aa  344  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  80.1 
 
 		 342 aa  344  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  76.02 
 
 		 342 aa  328  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2271  DNA-binding transcriptional repressor MalI  55.37 
 
 		 352 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.485606  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  44.04 
 
 		 340 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  31.69 
 
 		 341 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0983  LacI family transcription regulator  30.96 
 
 		 338 aa  97.1  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  0.446903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 350 aa  81.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  32.95 
 
 		 357 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 340 aa  78.2  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.53 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  28.72 
 
 		 358 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  29.11 
 
 		 335 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0568  LacI family transcription regulator  25.6 
 
 		 339 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000865309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  29.05 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  26.53 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 335 aa  72  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 		 352 aa  72  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  27.47 
 
 		 351 aa  71.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  23.91 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  24.57 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  26.26 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.11 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  28.19 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  25.84 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.7 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  31.93 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  26.86 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  26.97 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 		 341 aa  68.6  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  26.37 
 
 		 352 aa  68.6  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  32.03 
 
 		 326 aa  68.2  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 337 aa  67.8  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  29.11 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.11 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  28.8 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.32 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  29.21 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  35.92 
 
 		 329 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  36.42 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.71 
 
 		 336 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  28.3 
 
 		 365 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  28.72 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  28.65 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  27.66 
 
 		 339 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  31.54 
 
 		 352 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  25.99 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  22.51 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  27.53 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.22 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  32.24 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  30.4 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  27.37 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  26.97 
 
 		 323 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1526  transcriptional regulator, LacI family  27.18 
 
 		 353 aa  65.1  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.291045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.17 
 
 		 334 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  25.42 
 
 		 335 aa  65.1  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.8 
 
 		 335 aa  64.7  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 348 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  27.8 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  27.03 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  27.57 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  26.4 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  26.4 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  30.26 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  27.89 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  24.74 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.27 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.77 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  28.64 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  24.59 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0115  transcriptional repressor  27.27 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.88 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  24.31 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.64 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  27.54 
 
 		 357 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>