103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2316 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2316  DoxX  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  78.12 
 
 		 197 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  76.02 
 
 		 197 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  77.08 
 
 		 197 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  75.39 
 
 		 197 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  76.56 
 
 		 202 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  73.96 
 
 		 198 aa  297  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  76.44 
 
 		 197 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  75.92 
 
 		 197 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  75.92 
 
 		 197 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  73.82 
 
 		 197 aa  288  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  78.65 
 
 		 197 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  75 
 
 		 198 aa  279  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  78.01 
 
 		 195 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  73.94 
 
 		 196 aa  275  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  61.96 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  58.08 
 
 		 204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  59.56 
 
 		 196 aa  217  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  60.89 
 
 		 196 aa  217  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  60.37 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  44 
 
 		 232 aa  187  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  28.34 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  36.89 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  29.94 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  37.08 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  37.08 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  28.8 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  42.25 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  39.08 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  38 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  28.34 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  39.08 
 
 		 135 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  27.51 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  37.97 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  39.29 
 
 		 137 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  28.65 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.58 
 
 		 134 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  37.78 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  34.51 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  36.49 
 
 		 133 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  27.17 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  27.65 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  32.09 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  33.67 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  32.94 
 
 		 127 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  31.52 
 
 		 147 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  34.29 
 
 		 154 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40.79 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  33.04 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  28.71 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  37.04 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  32.28 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  34.07 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  33.67 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  33.71 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  34.69 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  33.04 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  33.67 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.58 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  35.16 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  35.56 
 
 		 144 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  33.04 
 
 		 154 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  35.8 
 
 		 137 aa  44.7  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  26.74 
 
 		 149 aa  45.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  31.48 
 
 		 147 aa  44.7  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  39 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  35.8 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  40.4 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  40.4 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  40.4 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  30.19 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  35.71 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  32.24 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  38 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  38 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  38 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  27.32 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  37.5 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  33.67 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  31.19 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0991  hypothetical protein  38.61 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  37.74 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  33.73 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  35.48 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  40 
 
 		 131 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  33.67 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  42.42 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  29.35 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  32.91 
 
 		 143 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.58 
 
 		 154 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  38.89 
 
 		 153 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  35 
 
 		 177 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  33.67 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  33.67 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  33.67 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  41.89 
 
 		 131 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>