More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1599 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  306  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  48.91 
 
 
186 aa  114  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  54.95 
 
 
191 aa  110  9e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  88.14 
 
 
153 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  68.83 
 
 
187 aa  97.1  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  65.79 
 
 
170 aa  90.9  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  50 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  44.44 
 
 
133 aa  84.3  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  66.67 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  55.56 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  55.56 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  55.56 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  38.13 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  38.13 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  50 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  74.36 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  49.12 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  55.1 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  48.21 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  71.79 
 
 
195 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  64.44 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.25 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  41.54 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.37 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  48.15 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  43.1 
 
 
210 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  60.42 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  69.44 
 
 
232 aa  53.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.13 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  54.9 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  38.98 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  32.18 
 
 
231 aa  51.2  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  38.37 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  48.94 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  50.88 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  32.11 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.45 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  45.83 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  52.94 
 
 
205 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  52.94 
 
 
205 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  52.94 
 
 
205 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.33 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  47.54 
 
 
211 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.81 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  47.92 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  52.94 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  46.81 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  52.94 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  50.98 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  52.94 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  37.93 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  52.94 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.98 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  64.71 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.64 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  40.68 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  38.6 
 
 
221 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.33 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  57.89 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  60 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  40.62 
 
 
212 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  52 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  50 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.33 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  46.51 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  58.54 
 
 
187 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  45.31 
 
 
229 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  61.76 
 
 
218 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.09 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  41.51 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  54.35 
 
 
195 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  28.95 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  53.85 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  41.79 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  31.4 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  60 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  61.76 
 
 
205 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  39.39 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  27.73 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  27.73 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.98 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  38.96 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.3 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.78 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.98 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.62 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.28 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1480  transformation system protein  45.76 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.754405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  53.85 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  43.64 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.98 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  47.83 
 
 
172 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  45.65 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
145 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  74.07 
 
 
220 aa  47  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
145 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
145 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.72 
 
 
171 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>