More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0805 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0805  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 		 186 aa  390  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1504  formate dehydrogenase  68.6 
 
 		 180 aa  256  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  70.29 
 
 		 932 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  68.02 
 
 		 934 aa  251  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2075  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  62.92 
 
 		 188 aa  249  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  60 
 
 		 940 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  49.73 
 
 		 949 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  48.89 
 
 		 949 aa  188  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  49.19 
 
 		 949 aa  187  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  52.3 
 
 		 949 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  53.67 
 
 		 951 aa  187  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  52.3 
 
 		 949 aa  187  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.57 
 
 		 949 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  49.17 
 
 		 950 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  49.17 
 
 		 950 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  49.19 
 
 		 949 aa  185  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  48.13 
 
 		 951 aa  185  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.85 
 
 		 949 aa  185  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  52.54 
 
 		 951 aa  184  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  53.14 
 
 		 986 aa  184  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  48.62 
 
 		 950 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  48.62 
 
 		 950 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  48.57 
 
 		 950 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  48.57 
 
 		 950 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  48 
 
 		 950 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.96 
 
 		 950 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  47.7 
 
 		 950 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  47.7 
 
 		 950 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  47.7 
 
 		 950 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  47.7 
 
 		 950 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  47.7 
 
 		 950 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  50 
 
 		 953 aa  177  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.43 
 
 		 950 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  47.13 
 
 		 950 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  47.13 
 
 		 950 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  47.13 
 
 		 950 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  48.86 
 
 		 964 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  47.13 
 
 		 951 aa  175  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  46.55 
 
 		 951 aa  175  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  47.13 
 
 		 951 aa  175  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  45.9 
 
 		 957 aa  175  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  50 
 
 		 987 aa  174  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  45.76 
 
 		 951 aa  174  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  49.71 
 
 		 951 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  48.35 
 
 		 973 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  49.71 
 
 		 983 aa  171  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  49.17 
 
 		 962 aa  171  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  48.13 
 
 		 989 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  48.04 
 
 		 979 aa  168  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  48 
 
 		 973 aa  167  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  47.06 
 
 		 989 aa  166  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  46.07 
 
 		 1012 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  45.11 
 
 		 992 aa  165  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  45.45 
 
 		 986 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  47.78 
 
 		 1025 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  43.68 
 
 		 970 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  58.59 
 
 		 980 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  58.59 
 
 		 980 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  58.59 
 
 		 980 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  44.97 
 
 		 996 aa  161  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  45.16 
 
 		 988 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  57.81 
 
 		 980 aa  160  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  44.92 
 
 		 991 aa  160  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  47.19 
 
 		 994 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  43.85 
 
 		 991 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  46.93 
 
 		 1001 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  46.93 
 
 		 1001 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  43.82 
 
 		 999 aa  154  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  41.48 
 
 		 1111 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.22 
 
 		 662 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.11 
 
 		 685 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  45.11 
 
 		 355 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2089  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  34.54 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.578931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1796  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.91 
 
 		 135 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.02 
 
 		 1020 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.02 
 
 		 1020 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.46 
 
 		 893 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 		 879 aa  102  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2590  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.16 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.22 
 
 		 359 aa  101  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.91 
 
 		 893 aa  100  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.46 
 
 		 900 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0954  molybdopterin oxidoreductase  31.42 
 
 		 1168 aa  100  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.859689  normal  0.0860777 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.91 
 
 		 676 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.08 
 
 		 1010 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.23 
 
 		 657 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.84 
 
 		 1016 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.28 
 
 		 657 aa  99.4  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.91 
 
 		 676 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0453  molybdopterin oxidoreductase  32.31 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.23 
 
 		 674 aa  98.6  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.04 
 
 		 724 aa  98.6  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.91 
 
 		 677 aa  98.6  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2268  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  34.2 
 
 		 190 aa  97.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.15 
 
 		 676 aa  97.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.93 
 
 		 979 aa  96.3  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.46 
 
 		 674 aa  96.3  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.2 
 
 		 1009 aa  95.9  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.64 
 
 		 984 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.64 
 
 		 984 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>