41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0761 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  35 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  34.6 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  32.16 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  34.48 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  29.81 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  29.8 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  31.47 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.42 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1341  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.18 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal  0.391023 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0249  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.75 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  28.4 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1640  conjugal transfer protein trbJ, putative  26.18 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  28.02 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2504  conjugal transfer protein TrbJ  30.88 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  26.53 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3193  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.04 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2845  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.3 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13713  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  25.93 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2647  conjugal transfer protein TrbJ  29.93 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  26.83 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  26.84 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  25.53 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  25.61 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  28.05 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  25.93 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  24.55 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  26.46 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  26.22 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  26.22 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  25.4 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  26.92 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  25.43 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  26.46 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  25.54 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  22.13 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  25.99 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  26.67 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  25.99 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  25 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  25.45 
 
 		 243 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>