17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2504 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2504  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  35.09 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  29.55 
 
 		 266 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  26.91 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  29.82 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  30.29 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  29.95 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  26.64 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  30.65 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1640  conjugal transfer protein trbJ, putative  27.6 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1341  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.05 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal  0.391023 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0249  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.6 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.32 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  27.12 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  26.76 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3193  P-type conjugative transfer protein TrbJ  23.64 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  28.65 
 
 		 260 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>