127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2807 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  100 
 
 		 503 aa  1054    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  50 
 
 		 502 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  47 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  45.71 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  45.71 
 
 		 502 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  46.08 
 
 		 494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  43.45 
 
 		 510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  46.18 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  43.2 
 
 		 509 aa  448  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  43.03 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  43.57 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  46.37 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  43.03 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  44.31 
 
 		 497 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  44.49 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  43.89 
 
 		 499 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  44.24 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  44.04 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  44.04 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  44.04 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  44.09 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  43.23 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  42.45 
 
 		 496 aa  428  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  44.67 
 
 		 498 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  43.71 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  43.65 
 
 		 507 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  42.12 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  44.65 
 
 		 498 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  42.35 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  42.69 
 
 		 502 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  42.54 
 
 		 509 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  41.77 
 
 		 506 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  41.88 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  41.88 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  39.92 
 
 		 518 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  42.45 
 
 		 507 aa  415  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  41.57 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  42.6 
 
 		 505 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  42.37 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  41.78 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  40.61 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  42 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  37.89 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  41 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  40.04 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  41.9 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  39.92 
 
 		 505 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  41.16 
 
 		 740 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  41.05 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  40.56 
 
 		 515 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  41.19 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  42.63 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  40.08 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  42.06 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  39.8 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  40.24 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  40.17 
 
 		 502 aa  364  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  35.4 
 
 		 499 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  36.84 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.18 
 
 		 505 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  37.12 
 
 		 538 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  37.12 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  37.26 
 
 		 538 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.05 
 
 		 517 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  37.26 
 
 		 538 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  37.26 
 
 		 538 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.76 
 
 		 508 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  32.82 
 
 		 532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.47 
 
 		 529 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 508 aa  250  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.47 
 
 		 529 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.75 
 
 		 537 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  35.33 
 
 		 513 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  35.33 
 
 		 513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  36.7 
 
 		 513 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.73 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 508 aa  243  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  33.33 
 
 		 508 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 502 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  32.7 
 
 		 526 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  36.99 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  30.31 
 
 		 524 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  33.46 
 
 		 527 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  35 
 
 		 522 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 508 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  36.79 
 
 		 524 aa  232  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  31.37 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.79 
 
 		 524 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  32.83 
 
 		 499 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  32.69 
 
 		 501 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  32.17 
 
 		 507 aa  229  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  32.15 
 
 		 503 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  29.7 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  32.51 
 
 		 528 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  29.4 
 
 		 517 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  34.77 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>