256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3689 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  56.64 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.13 
 
 		 271 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.86 
 
 		 266 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.52 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  54.84 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  54.84 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  54.3 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  55.81 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  53.85 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.03 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  53.73 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.64 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.04 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.29 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  52.47 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.49 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  53.57 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.37 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  54.33 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.54 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.51 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.17 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  55.42 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.53 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.07 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.95 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.37 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.9 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  43.78 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.87 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.03 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.06 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.82 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.63 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.63 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.23 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.2 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.63 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.54 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  40.48 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  43.35 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.87 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.72 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  41.87 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.13 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.15 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.53 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.26 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.91 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.21 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.54 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.92 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.83 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  44.26 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.92 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.84 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.17 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.26 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  45 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.17 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.17 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.73 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  45.24 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.73 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  42.73 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.53 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.65 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.79 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.36 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.54 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.93 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.11 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.15 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.93 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.17 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  40.76 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  40.94 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  41.8 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  38.93 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.32 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.32 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.11 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  40.34 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  45.25 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.12 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  41.13 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.91 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.38 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  41.39 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.3 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.48 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.85 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.1 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.78 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  44.76 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  43.66 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.78 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.5 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2360  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.31 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>