185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2063 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
779 aa  1574    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  89.2 
 
 
779 aa  1396    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  41.1 
 
 
804 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  39.74 
 
 
795 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  39.66 
 
 
795 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  42.69 
 
 
773 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  39.61 
 
 
795 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  40.77 
 
 
799 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  36.84 
 
 
778 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  35.92 
 
 
819 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  38.24 
 
 
805 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  38.33 
 
 
762 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  36.69 
 
 
814 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  38.08 
 
 
760 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  36.65 
 
 
816 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  37.76 
 
 
793 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  36.93 
 
 
773 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  36.76 
 
 
779 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  37.67 
 
 
737 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  35.97 
 
 
770 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  36.22 
 
 
763 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  36.36 
 
 
769 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  36.03 
 
 
772 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  35.43 
 
 
842 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  37.6 
 
 
789 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  33.91 
 
 
860 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  33.8 
 
 
854 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  33.41 
 
 
854 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  33.61 
 
 
854 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  34.85 
 
 
824 aa  386  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  34.12 
 
 
855 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  34.41 
 
 
855 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  34.16 
 
 
855 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 
855 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  33.33 
 
 
841 aa  369  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  32.79 
 
 
852 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.59 
 
 
724 aa  137  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  24.84 
 
 
725 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  24.28 
 
 
708 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  24.42 
 
 
674 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.51 
 
 
701 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.96 
 
 
694 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  25.69 
 
 
718 aa  114  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.32 
 
 
712 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  24.94 
 
 
809 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.81 
 
 
796 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  23.58 
 
 
796 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  23.58 
 
 
796 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.58 
 
 
796 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  26.18 
 
 
792 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.13 
 
 
796 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.36 
 
 
796 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.36 
 
 
796 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.81 
 
 
796 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.27 
 
 
796 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  25.31 
 
 
864 aa  71.6  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  24.43 
 
 
790 aa  71.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  27.5 
 
 
819 aa  70.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  23.95 
 
 
833 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  23.76 
 
 
769 aa  69.3  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  22.9 
 
 
796 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.29 
 
 
818 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  22.77 
 
 
812 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  26.56 
 
 
827 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  31.33 
 
 
821 aa  65.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  23.95 
 
 
795 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  27.07 
 
 
784 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  27.56 
 
 
829 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  25.58 
 
 
787 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  21.3 
 
 
811 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.67 
 
 
855 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  23.83 
 
 
795 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  26.93 
 
 
809 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.81 
 
 
808 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  23.32 
 
 
795 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  22.91 
 
 
848 aa  63.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  25.41 
 
 
797 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  24.08 
 
 
827 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  31.43 
 
 
807 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1767  Penicillin amidase  31.65 
 
 
963 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439064  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  27.19 
 
 
947 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  27.98 
 
 
889 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  24.14 
 
 
812 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  23.06 
 
 
795 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  23.68 
 
 
786 aa  60.1  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  25.78 
 
 
760 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  26 
 
 
817 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0953  peptidase  26.29 
 
 
886 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  23.1 
 
 
823 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0612  peptidase S45 penicillin amidase  31.65 
 
 
815 aa  58.9  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.928673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0792  putative penicillin amidase  27.14 
 
 
796 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  23.96 
 
 
813 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  30.58 
 
 
836 aa  58.9  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0780  peptidase  26.06 
 
 
796 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  25.52 
 
 
809 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  26.61 
 
 
947 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  29.03 
 
 
825 aa  57.4  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  23.53 
 
 
813 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  25.89 
 
 
841 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  23.53 
 
 
813 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>