More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2250 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2250  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.756191  hitchhiker  0.00780881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  46.43 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  44.13 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  43.9 
 
 		 268 aa  207  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  43.58 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  44.21 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  44.26 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  43.32 
 
 		 248 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0604  hypothetical protein  43.43 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.67 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  42.39 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  43.37 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  56.17 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  43.37 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0621  hypothetical protein  43.43 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  43.78 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  42.51 
 
 		 248 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  44.53 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  43.21 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.31 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.02 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  43.98 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  44.53 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.55 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.91 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  42.21 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  43.32 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  43.32 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.15 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  43.43 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  43.32 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.95 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.15 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.34 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  43.62 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0620  hypothetical protein  55.9 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  43.93 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  43.32 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.34 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  44.8 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  43.6 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0603  hypothetical protein  55.28 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  43.37 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  43.21 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  43.32 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  42.51 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  41.77 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  41.77 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  41.77 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  41.77 
 
 		 248 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.49 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  41.77 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  41.77 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  41.77 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  43.09 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  42.91 
 
 		 246 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  42.91 
 
 		 246 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.5 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  42.97 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  43.32 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.94 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.15 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  42.23 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  41.77 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  42.97 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2305  hypothetical protein  54.04 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  42.97 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  41.8 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  42.32 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.27 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  42.97 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2322  hypothetical protein  42.23 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  41.49 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  44.35 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  42.17 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  42.15 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.49 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  43.1 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  41.13 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.47 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2297  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0078554  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  40.91 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  42.39 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  42.15 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.74 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  40.74 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  49.69 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  42.51 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  42.17 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  42.17 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.31 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  42.11 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.16 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>