201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2659 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  53.57 
 
 		 714 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  53.43 
 
 		 712 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  52.84 
 
 		 687 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  59.24 
 
 		 713 aa  811    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  54.79 
 
 		 703 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  54.03 
 
 		 703 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  53.99 
 
 		 734 aa  683    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  54.29 
 
 		 685 aa  676    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  62.77 
 
 		 694 aa  846    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1434    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  52.22 
 
 		 706 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  50.07 
 
 		 717 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  49.58 
 
 		 696 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  53.07 
 
 		 714 aa  701    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  52.22 
 
 		 706 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  52.29 
 
 		 708 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  60.57 
 
 		 703 aa  786    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  54.84 
 
 		 709 aa  681    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  54.84 
 
 		 714 aa  712    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  52.89 
 
 		 687 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  53.26 
 
 		 687 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  53.64 
 
 		 708 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  49.37 
 
 		 711 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  49.43 
 
 		 717 aa  631  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  50.89 
 
 		 694 aa  631  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  49.65 
 
 		 706 aa  628  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  47.32 
 
 		 716 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  47.39 
 
 		 709 aa  568  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  45.39 
 
 		 723 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  52.39 
 
 		 577 aa  558  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  52.46 
 
 		 577 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  44.81 
 
 		 759 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  49.35 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  47.98 
 
 		 582 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  48.68 
 
 		 536 aa  435  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  40.15 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  41.68 
 
 		 694 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  37.92 
 
 		 715 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  35.12 
 
 		 636 aa  340  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  39.56 
 
 		 528 aa  337  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  35.4 
 
 		 615 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  37.12 
 
 		 683 aa  313  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  36.05 
 
 		 681 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  36.32 
 
 		 682 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  35.74 
 
 		 683 aa  300  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  35.88 
 
 		 684 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  35.9 
 
 		 690 aa  296  8e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  36.19 
 
 		 688 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  36.19 
 
 		 688 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  35.69 
 
 		 684 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  31.86 
 
 		 658 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  34.92 
 
 		 687 aa  280  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  32.52 
 
 		 654 aa  277  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  35.15 
 
 		 679 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  35.69 
 
 		 687 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  34.9 
 
 		 680 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 645 aa  267  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  34.3 
 
 		 679 aa  264  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  34.36 
 
 		 765 aa  263  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  33.63 
 
 		 740 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  34.92 
 
 		 689 aa  257  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  33.33 
 
 		 709 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  30.33 
 
 		 751 aa  253  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  31.07 
 
 		 667 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.07 
 
 		 677 aa  248  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  33.71 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  34.08 
 
 		 754 aa  237  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  31.48 
 
 		 727 aa  235  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  46.22 
 
 		 369 aa  231  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.65 
 
 		 690 aa  220  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  31.13 
 
 		 623 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  30.66 
 
 		 669 aa  208  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  64.56 
 
 		 156 aa  194  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  28.49 
 
 		 662 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  28.27 
 
 		 662 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  64.71 
 
 		 172 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  71.07 
 
 		 133 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.85 
 
 		 654 aa  163  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  27.31 
 
 		 624 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  68.33 
 
 		 129 aa  160  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  28.53 
 
 		 654 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  69.17 
 
 		 129 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  28.4 
 
 		 652 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  26.94 
 
 		 624 aa  157  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  46.3 
 
 		 597 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  28.08 
 
 		 652 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  26.78 
 
 		 729 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  37.81 
 
 		 380 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  36.26 
 
 		 626 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  36.26 
 
 		 626 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  36.26 
 
 		 626 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  35.9 
 
 		 624 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  35.9 
 
 		 624 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  28.08 
 
 		 670 aa  144  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  58.87 
 
 		 133 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  27.31 
 
 		 595 aa  138  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  33.16 
 
 		 603 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  33.93 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  32.57 
 
 		 606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  27.42 
 
 		 623 aa  120  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>