237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2859 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  100 
 
 		 726 aa  1471    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  62.31 
 
 		 715 aa  802    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  75.68 
 
 		 694 aa  972    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  61.96 
 
 		 528 aa  631  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  47.98 
 
 		 708 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  47 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  46.98 
 
 		 687 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  46.89 
 
 		 687 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  44.24 
 
 		 706 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  44.3 
 
 		 703 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  46.36 
 
 		 687 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  44.2 
 
 		 717 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  42.55 
 
 		 711 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  45.11 
 
 		 703 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  42.39 
 
 		 696 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  45.8 
 
 		 685 aa  475  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  41.75 
 
 		 714 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  42.47 
 
 		 712 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  43.03 
 
 		 694 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  43.67 
 
 		 703 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  41.91 
 
 		 708 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  41.57 
 
 		 706 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  41.94 
 
 		 714 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  41.57 
 
 		 706 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  43.11 
 
 		 714 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  42.5 
 
 		 734 aa  452  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  40.2 
 
 		 713 aa  445  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  41.96 
 
 		 709 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  41.82 
 
 		 717 aa  439  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  40.27 
 
 		 713 aa  422  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  39.1 
 
 		 716 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  44.34 
 
 		 577 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  46.75 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  39.32 
 
 		 759 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  42.36 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  38.98 
 
 		 694 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  42.78 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  42.93 
 
 		 582 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  39.31 
 
 		 636 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  37.65 
 
 		 723 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  35.56 
 
 		 615 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  34.8 
 
 		 645 aa  323  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  35.28 
 
 		 654 aa  301  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  33.76 
 
 		 683 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  34.03 
 
 		 690 aa  290  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  34.51 
 
 		 682 aa  287  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  32.9 
 
 		 684 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  32.72 
 
 		 684 aa  283  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  34.74 
 
 		 683 aa  278  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  32.15 
 
 		 667 aa  277  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  32.04 
 
 		 658 aa  277  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  32.86 
 
 		 688 aa  274  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  32.86 
 
 		 688 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  33.19 
 
 		 681 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  34.22 
 
 		 679 aa  270  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  33.8 
 
 		 687 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  31.55 
 
 		 751 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  34.13 
 
 		 687 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  32.1 
 
 		 740 aa  261  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  34.26 
 
 		 680 aa  260  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  34.43 
 
 		 679 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  32.56 
 
 		 709 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  32.74 
 
 		 677 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  32.95 
 
 		 765 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  33.43 
 
 		 689 aa  249  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  32.7 
 
 		 692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  31.96 
 
 		 727 aa  231  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  30.94 
 
 		 623 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  33.23 
 
 		 754 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  30.61 
 
 		 662 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.13 
 
 		 662 aa  212  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  28.44 
 
 		 669 aa  197  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7316  putative ParB-like nuclease  82.76 
 
 		 146 aa  197  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  43.2 
 
 		 369 aa  191  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  27.67 
 
 		 624 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  27.67 
 
 		 624 aa  184  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  28.42 
 
 		 626 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  28.42 
 
 		 626 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  28.42 
 
 		 626 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  27.84 
 
 		 670 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  27.83 
 
 		 624 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.03 
 
 		 690 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  27.95 
 
 		 624 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  28.12 
 
 		 652 aa  177  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  27.89 
 
 		 654 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  27.62 
 
 		 654 aa  170  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  27.16 
 
 		 652 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  39.04 
 
 		 597 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  29.1 
 
 		 660 aa  153  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  36.86 
 
 		 380 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  29.01 
 
 		 660 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  26.51 
 
 		 729 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  32.74 
 
 		 606 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  33.25 
 
 		 607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  33.33 
 
 		 603 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  32.82 
 
 		 389 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  34.33 
 
 		 595 aa  127  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  32.07 
 
 		 603 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0406  nuclease  56.03 
 
 		 325 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  24.09 
 
 		 623 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>