105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1468 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  100 
 
 		 129 aa  258  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  86.82 
 
 		 129 aa  226  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  87.18 
 
 		 703 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  86.32 
 
 		 703 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  79.17 
 
 		 687 aa  192  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  79.17 
 
 		 687 aa  192  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  75.19 
 
 		 133 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  76.67 
 
 		 687 aa  188  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  75.61 
 
 		 714 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  75.83 
 
 		 708 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  77.59 
 
 		 709 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  69.92 
 
 		 714 aa  178  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  75.63 
 
 		 713 aa  178  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  73.98 
 
 		 734 aa  176  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  71.54 
 
 		 685 aa  174  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  71.31 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  69.05 
 
 		 708 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  67.77 
 
 		 711 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  70.73 
 
 		 712 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  67.48 
 
 		 706 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  67.48 
 
 		 706 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  69.11 
 
 		 714 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  64.66 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  68.33 
 
 		 713 aa  160  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  67.21 
 
 		 706 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  63.93 
 
 		 717 aa  157  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  64.8 
 
 		 694 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  62.9 
 
 		 694 aa  150  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  63.93 
 
 		 703 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  61.29 
 
 		 717 aa  147  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  64.91 
 
 		 709 aa  146  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  60.16 
 
 		 696 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  55.74 
 
 		 759 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  64.66 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2279  hypothetical protein  69.74 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.196831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  46.92 
 
 		 723 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  46.92 
 
 		 716 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7316  putative ParB-like nuclease  41.98 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  46.08 
 
 		 658 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  40.18 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  41.35 
 
 		 688 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  41.35 
 
 		 688 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  39.25 
 
 		 690 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  41.28 
 
 		 662 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  43.14 
 
 		 636 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  39.45 
 
 		 662 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  36.79 
 
 		 726 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  41.96 
 
 		 684 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  41.07 
 
 		 684 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  37.74 
 
 		 694 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  40.57 
 
 		 667 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  35.78 
 
 		 485 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  43.27 
 
 		 680 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  41.35 
 
 		 681 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  41.35 
 
 		 683 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0406  nuclease  42.31 
 
 		 325 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  43.27 
 
 		 687 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  41.35 
 
 		 690 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  39.6 
 
 		 682 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  40.38 
 
 		 683 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 645 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  40.95 
 
 		 679 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  41.35 
 
 		 687 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  35.85 
 
 		 669 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  36.9 
 
 		 715 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  36.7 
 
 		 765 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  40 
 
 		 679 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  32.26 
 
 		 285 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  34.48 
 
 		 300 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  39.44 
 
 		 279 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  33.94 
 
 		 785 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  43.27 
 
 		 689 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  30.23 
 
 		 300 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  36.19 
 
 		 727 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.48 
 
 		 296 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  43.86 
 
 		 677 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  28.57 
 
 		 292 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  40.54 
 
 		 692 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  38.75 
 
 		 624 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  34.55 
 
 		 624 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  34.55 
 
 		 624 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  37.35 
 
 		 626 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  38.75 
 
 		 624 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  37.35 
 
 		 626 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  37.35 
 
 		 626 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  30.39 
 
 		 310 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  29.89 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  37.68 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  37.68 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1816  parB-like partition protein  32.32 
 
 		 576 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.357609  normal  0.915413 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  34.58 
 
 		 729 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  29.46 
 
 		 299 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  34.26 
 
 		 472 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  33.01 
 
 		 654 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  33.02 
 
 		 311 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  34.09 
 
 		 595 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5824  parB-like partition protein  33.04 
 
 		 312 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  33.71 
 
 		 309 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  36.92 
 
 		 597 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>