More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1478 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  84.73 
 
 		 679 aa  1074    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  71.53 
 
 		 679 aa  868    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  85.63 
 
 		 688 aa  1129    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  85.09 
 
 		 683 aa  1125    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  87.81 
 
 		 689 aa  1119    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  74.34 
 
 		 682 aa  991    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  89.1 
 
 		 687 aa  1158    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  86.78 
 
 		 692 aa  1055    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  71.91 
 
 		 681 aa  931    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  56.06 
 
 		 677 aa  636    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  75.95 
 
 		 683 aa  1010    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  100 
 
 		 680 aa  1349    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  85.63 
 
 		 688 aa  1129    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  75.47 
 
 		 690 aa  999    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  84.01 
 
 		 687 aa  1052    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  73.65 
 
 		 684 aa  974    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  74.24 
 
 		 684 aa  959    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  83.92 
 
 		 597 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  38.36 
 
 		 667 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  38.62 
 
 		 658 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  39.62 
 
 		 636 aa  349  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  40.15 
 
 		 709 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  39.64 
 
 		 765 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  37.43 
 
 		 703 aa  337  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  40.91 
 
 		 754 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  39.27 
 
 		 740 aa  330  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  38.12 
 
 		 623 aa  320  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  36.5 
 
 		 708 aa  312  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  38.57 
 
 		 727 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  36.28 
 
 		 709 aa  308  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  37.01 
 
 		 715 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  33.96 
 
 		 751 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  37.15 
 
 		 687 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  37.26 
 
 		 687 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  36.19 
 
 		 687 aa  301  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  38.07 
 
 		 615 aa  299  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  35.39 
 
 		 685 aa  299  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  33.97 
 
 		 706 aa  293  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  33.97 
 
 		 706 aa  293  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  34.43 
 
 		 708 aa  290  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  36.54 
 
 		 709 aa  289  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  36.93 
 
 		 694 aa  289  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  35.47 
 
 		 713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  34.82 
 
 		 734 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  35.91 
 
 		 654 aa  282  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  36.05 
 
 		 713 aa  282  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  34.29 
 
 		 714 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  34.92 
 
 		 694 aa  281  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  35.12 
 
 		 711 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  34.21 
 
 		 714 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 645 aa  280  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  35.14 
 
 		 703 aa  280  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  36.34 
 
 		 694 aa  280  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  34.06 
 
 		 726 aa  277  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  34.39 
 
 		 717 aa  274  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  33.63 
 
 		 714 aa  273  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  33.43 
 
 		 712 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  33.95 
 
 		 703 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  33.71 
 
 		 759 aa  261  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  33.38 
 
 		 696 aa  261  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  34.63 
 
 		 706 aa  260  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  32.3 
 
 		 717 aa  258  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  32.4 
 
 		 669 aa  228  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  32.33 
 
 		 716 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  31.12 
 
 		 652 aa  226  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  30.79 
 
 		 723 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  30.11 
 
 		 654 aa  213  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  45.25 
 
 		 380 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  31.1 
 
 		 654 aa  213  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  29.64 
 
 		 652 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  34.26 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  32.01 
 
 		 670 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  31.76 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  31.61 
 
 		 662 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  31.85 
 
 		 662 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  33.33 
 
 		 577 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  32.64 
 
 		 536 aa  190  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  31.93 
 
 		 528 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  32.37 
 
 		 546 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.33 
 
 		 690 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  28.4 
 
 		 624 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  28.7 
 
 		 624 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  28.98 
 
 		 624 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  28.98 
 
 		 624 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  31.4 
 
 		 595 aa  154  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  38.59 
 
 		 626 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  38.59 
 
 		 626 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  38.59 
 
 		 626 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  27.79 
 
 		 729 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  29.37 
 
 		 660 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  34.08 
 
 		 485 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  29.04 
 
 		 660 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  26.98 
 
 		 422 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  34.31 
 
 		 295 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  34.16 
 
 		 623 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  34.74 
 
 		 603 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  35.66 
 
 		 607 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  36.81 
 
 		 389 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  35.31 
 
 		 603 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  36.3 
 
 		 606 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>