87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0011 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  79.38 
 
 		 654 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  875    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  81.75 
 
 		 654 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  79.86 
 
 		 652 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  78.35 
 
 		 652 aa  684    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  53.25 
 
 		 669 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  35.47 
 
 		 670 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  30.17 
 
 		 636 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  28.1 
 
 		 682 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  27.39 
 
 		 684 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  27.81 
 
 		 683 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  26.17 
 
 		 684 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  28.74 
 
 		 727 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  27.59 
 
 		 681 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  27.15 
 
 		 690 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  26.38 
 
 		 683 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  27.67 
 
 		 677 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  28.48 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  25.11 
 
 		 688 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  25.11 
 
 		 688 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  25.78 
 
 		 658 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  26.88 
 
 		 740 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  28.38 
 
 		 765 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  23.37 
 
 		 623 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  27.15 
 
 		 680 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  24.6 
 
 		 689 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  25.81 
 
 		 679 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  26.22 
 
 		 687 aa  103  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  26.46 
 
 		 715 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  26.12 
 
 		 717 aa  99.8  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  25.44 
 
 		 716 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  24.51 
 
 		 703 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  25.78 
 
 		 546 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  24.72 
 
 		 679 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  25.38 
 
 		 582 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  26.43 
 
 		 667 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  26.86 
 
 		 577 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  26.67 
 
 		 754 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  26.37 
 
 		 708 aa  93.6  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  25.32 
 
 		 706 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  25.32 
 
 		 706 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  23.74 
 
 		 687 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  24.81 
 
 		 295 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  25.73 
 
 		 685 aa  90.5  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  26.72 
 
 		 709 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  26.26 
 
 		 709 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  25.05 
 
 		 726 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  24.48 
 
 		 751 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  23.78 
 
 		 714 aa  87  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  25.35 
 
 		 615 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  27.4 
 
 		 714 aa  87  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  26.34 
 
 		 708 aa  86.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  26.32 
 
 		 703 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  23.54 
 
 		 713 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  24.79 
 
 		 703 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  25.49 
 
 		 694 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  25.88 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  24.28 
 
 		 712 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  26.1 
 
 		 734 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  24.56 
 
 		 694 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  25.49 
 
 		 577 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  24.41 
 
 		 711 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  24.83 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  25.11 
 
 		 694 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  23.42 
 
 		 706 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  23.68 
 
 		 714 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  25.82 
 
 		 709 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  24.68 
 
 		 687 aa  74.3  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  25.17 
 
 		 536 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  25.78 
 
 		 654 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  26.4 
 
 		 687 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  25.45 
 
 		 687 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  25.35 
 
 		 645 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  24.19 
 
 		 696 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  23.63 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  25.71 
 
 		 662 aa  67.4  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  25.75 
 
 		 662 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  24.84 
 
 		 717 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  24.18 
 
 		 759 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  23.33 
 
 		 623 aa  56.6  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  24.65 
 
 		 660 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  26.82 
 
 		 597 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  24.73 
 
 		 660 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  31.1 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.77 
 
 		 595 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28 
 
 		 690 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  22.89 
 
 		 729 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>