218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3609 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  98.39 
 
 		 389 aa  713    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  96.2 
 
 		 603 aa  1094    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  100 
 
 		 606 aa  1192    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  96.53 
 
 		 607 aa  1092    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  94.55 
 
 		 603 aa  1066    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3852  hypothetical protein  93.07 
 
 		 560 aa  987    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921055  normal  0.646797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  39.21 
 
 		 623 aa  364  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1661  hypothetical protein  98.9 
 
 		 91 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0055577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  38.27 
 
 		 687 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  33.76 
 
 		 726 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  36.32 
 
 		 712 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  37.24 
 
 		 687 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  35.44 
 
 		 685 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  34.52 
 
 		 706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  34.45 
 
 		 636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  34.52 
 
 		 706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  32.9 
 
 		 703 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  35.11 
 
 		 708 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  36.32 
 
 		 714 aa  148  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  35.9 
 
 		 687 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  33.68 
 
 		 711 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  35.79 
 
 		 708 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  34.52 
 
 		 714 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  36.43 
 
 		 714 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  35.14 
 
 		 703 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  34.88 
 
 		 703 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  33.67 
 
 		 709 aa  144  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.51 
 
 		 690 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  28.95 
 
 		 626 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  28.95 
 
 		 626 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  35.59 
 
 		 734 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  28.95 
 
 		 626 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  34.61 
 
 		 713 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  35.22 
 
 		 709 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  28.57 
 
 		 624 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  34.32 
 
 		 694 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  27.3 
 
 		 624 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  33.33 
 
 		 717 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  33.25 
 
 		 615 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  30.13 
 
 		 652 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  29.49 
 
 		 662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  29.56 
 
 		 662 aa  134  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  34.16 
 
 		 694 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  27.58 
 
 		 729 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  27.66 
 
 		 624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  33.16 
 
 		 723 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  26.77 
 
 		 669 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  29.48 
 
 		 654 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  27.47 
 
 		 670 aa  131  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  27.36 
 
 		 624 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  34.01 
 
 		 716 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  29.64 
 
 		 654 aa  128  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  30.41 
 
 		 713 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  32.15 
 
 		 696 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  38.43 
 
 		 759 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  28.83 
 
 		 652 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  27.42 
 
 		 715 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  33.54 
 
 		 706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  33.94 
 
 		 740 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  29.04 
 
 		 667 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  29.06 
 
 		 681 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  31.59 
 
 		 645 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  37.23 
 
 		 690 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.63 
 
 		 683 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  30.93 
 
 		 717 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  34.58 
 
 		 754 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  31.39 
 
 		 751 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.88 
 
 		 684 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  39.16 
 
 		 577 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  28.18 
 
 		 654 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  34.07 
 
 		 684 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  30.39 
 
 		 694 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  33.53 
 
 		 709 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  37.14 
 
 		 679 aa  112  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  35.19 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  35.19 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  29.57 
 
 		 765 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  35.69 
 
 		 679 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  35.23 
 
 		 682 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  34.62 
 
 		 687 aa  105  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  35.25 
 
 		 577 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  34.62 
 
 		 680 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  32.38 
 
 		 683 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  39.89 
 
 		 623 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  32.02 
 
 		 689 aa  101  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  35.31 
 
 		 692 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  35.87 
 
 		 727 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  33.81 
 
 		 687 aa  98.6  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  31.75 
 
 		 658 aa  93.6  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  31.42 
 
 		 582 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.11 
 
 		 595 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  38.15 
 
 		 597 aa  90.5  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.44 
 
 		 677 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  35.17 
 
 		 546 aa  90.1  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  27.63 
 
 		 660 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  40.45 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  34.4 
 
 		 536 aa  87.8  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  32.14 
 
 		 369 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  29.49 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  31.38 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>