206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3672 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  61.87 
 
 		 726 aa  798    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  60.43 
 
 		 694 aa  781    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  100 
 
 		 715 aa  1439    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  54.42 
 
 		 528 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  45.87 
 
 		 708 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  44.69 
 
 		 709 aa  505  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  40.39 
 
 		 711 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  43.59 
 
 		 717 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  41.69 
 
 		 706 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  41.64 
 
 		 687 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  40.84 
 
 		 687 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  42.01 
 
 		 703 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  42.63 
 
 		 696 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  41.51 
 
 		 703 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  41.91 
 
 		 687 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  41.58 
 
 		 714 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  41.91 
 
 		 708 aa  448  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  40.61 
 
 		 703 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  43.36 
 
 		 685 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  41.82 
 
 		 694 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  41.98 
 
 		 714 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  42.2 
 
 		 712 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  41.65 
 
 		 706 aa  439  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  41.65 
 
 		 706 aa  439  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  43.01 
 
 		 734 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  41.36 
 
 		 714 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  39.16 
 
 		 709 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  39.41 
 
 		 717 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  39.24 
 
 		 713 aa  409  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  39.1 
 
 		 759 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  40 
 
 		 636 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  37.92 
 
 		 713 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  37.75 
 
 		 694 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  38.5 
 
 		 723 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  42.91 
 
 		 536 aa  379  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  42.55 
 
 		 577 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  40.53 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  41.65 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  36.71 
 
 		 716 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  40.74 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  36.51 
 
 		 615 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  36.85 
 
 		 654 aa  333  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  37.8 
 
 		 682 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  36.98 
 
 		 683 aa  311  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 645 aa  310  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  34.78 
 
 		 658 aa  308  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  36.27 
 
 		 688 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  36.27 
 
 		 688 aa  307  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  35.57 
 
 		 690 aa  300  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  34.13 
 
 		 684 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.66 
 
 		 683 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  35.82 
 
 		 681 aa  290  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  35.97 
 
 		 680 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.97 
 
 		 677 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  36.23 
 
 		 687 aa  286  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.85 
 
 		 684 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  31.49 
 
 		 751 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  35.5 
 
 		 689 aa  283  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  35.88 
 
 		 679 aa  282  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  35.92 
 
 		 679 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  34.53 
 
 		 687 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  35.56 
 
 		 692 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  33.24 
 
 		 667 aa  273  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  34.88 
 
 		 623 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  32.97 
 
 		 709 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  33.05 
 
 		 740 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  33.92 
 
 		 765 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  33.1 
 
 		 727 aa  238  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  34.29 
 
 		 754 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.62 
 
 		 662 aa  217  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  29.27 
 
 		 669 aa  211  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  30.55 
 
 		 662 aa  210  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  30.05 
 
 		 654 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  30.12 
 
 		 652 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.23 
 
 		 690 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  30.21 
 
 		 654 aa  193  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  29.6 
 
 		 652 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  40.64 
 
 		 369 aa  187  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  29.18 
 
 		 670 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  28.21 
 
 		 729 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  38.57 
 
 		 597 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  27.42 
 
 		 626 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  27.42 
 
 		 626 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  27.42 
 
 		 626 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7316  putative ParB-like nuclease  68.75 
 
 		 146 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  35.55 
 
 		 380 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  26.69 
 
 		 624 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  26.31 
 
 		 624 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  26.47 
 
 		 624 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  26.46 
 
 		 624 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  29.37 
 
 		 595 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  26.45 
 
 		 660 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  26.39 
 
 		 660 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  24.39 
 
 		 623 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  33.93 
 
 		 295 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0406  nuclease  50.36 
 
 		 325 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  27.41 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  31.49 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  31.05 
 
 		 606 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  26.91 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>