192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3819 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  49.37 
 
 		 714 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  53.44 
 
 		 734 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  60.09 
 
 		 717 aa  818    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  54.17 
 
 		 706 aa  729    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  53.47 
 
 		 714 aa  718    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  100 
 
 		 723 aa  1462    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  51.51 
 
 		 708 aa  663    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  54.17 
 
 		 706 aa  729    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  56.08 
 
 		 714 aa  738    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  52.23 
 
 		 694 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  62.6 
 
 		 716 aa  876    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  56.18 
 
 		 712 aa  702    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  49.24 
 
 		 703 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  49.02 
 
 		 703 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  57.52 
 
 		 582 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  47.13 
 
 		 685 aa  592  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  46.27 
 
 		 709 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  44.93 
 
 		 713 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  45.87 
 
 		 708 aa  555  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  53.86 
 
 		 546 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  44.9 
 
 		 711 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  43.22 
 
 		 717 aa  545  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  44.37 
 
 		 713 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  42.84 
 
 		 706 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  44.52 
 
 		 687 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  44.32 
 
 		 687 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  45 
 
 		 687 aa  528  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  43.82 
 
 		 703 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  43.13 
 
 		 709 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  40.6 
 
 		 696 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  42.66 
 
 		 694 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  46.34 
 
 		 577 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  40.44 
 
 		 759 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  46.89 
 
 		 577 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  74 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  37.83 
 
 		 715 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  42.75 
 
 		 536 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  37.45 
 
 		 726 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  37.06 
 
 		 694 aa  349  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  40.04 
 
 		 528 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  33.38 
 
 		 636 aa  291  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  31.31 
 
 		 615 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  30.26 
 
 		 688 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  31.86 
 
 		 681 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  30.26 
 
 		 688 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  31.15 
 
 		 683 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  31.05 
 
 		 683 aa  232  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  30.36 
 
 		 667 aa  230  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  30.31 
 
 		 690 aa  228  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  31.38 
 
 		 679 aa  228  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  28.33 
 
 		 658 aa  227  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  32 
 
 		 677 aa  226  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  31.59 
 
 		 682 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  28.68 
 
 		 654 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  30.93 
 
 		 684 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  31.57 
 
 		 687 aa  220  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  32.22 
 
 		 679 aa  219  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  29.26 
 
 		 709 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  31.21 
 
 		 687 aa  216  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  30.79 
 
 		 680 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  30.86 
 
 		 765 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  27.94 
 
 		 751 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  30.63 
 
 		 689 aa  210  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  30.86 
 
 		 740 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  30.28 
 
 		 684 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  32.12 
 
 		 754 aa  204  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 645 aa  204  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  27.81 
 
 		 690 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  30.89 
 
 		 662 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.7 
 
 		 662 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  31.47 
 
 		 692 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  30.33 
 
 		 623 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  28.14 
 
 		 727 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  26.44 
 
 		 729 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  64.62 
 
 		 133 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  25.99 
 
 		 669 aa  142  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  45.62 
 
 		 156 aa  142  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  24.18 
 
 		 624 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  24.03 
 
 		 624 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  24.33 
 
 		 624 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  26.19 
 
 		 654 aa  127  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  24.33 
 
 		 624 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  28.43 
 
 		 623 aa  126  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  30.36 
 
 		 626 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  30.36 
 
 		 626 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  30.36 
 
 		 626 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  34.13 
 
 		 606 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  37.39 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  34.14 
 
 		 389 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  33.83 
 
 		 603 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  33.83 
 
 		 607 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  25.68 
 
 		 654 aa  120  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  25.5 
 
 		 670 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  25.38 
 
 		 652 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  32.63 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  25.08 
 
 		 652 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  27.84 
 
 		 660 aa  114  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3852  hypothetical protein  33.04 
 
 		 560 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921055  normal  0.646797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  47.11 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  45.96 
 
 		 172 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>