More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4146 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  55.12 
 
 		 708 aa  719    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  51.49 
 
 		 714 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  52.22 
 
 		 687 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  55.57 
 
 		 709 aa  730    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  60.52 
 
 		 711 aa  845    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  52.22 
 
 		 687 aa  680    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  48.2 
 
 		 713 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  52.36 
 
 		 687 aa  688    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  52.08 
 
 		 703 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  52.2 
 
 		 703 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  50.14 
 
 		 706 aa  653    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  50.14 
 
 		 706 aa  653    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  52.25 
 
 		 714 aa  691    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  50.07 
 
 		 713 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  100 
 
 		 717 aa  1444    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  62.84 
 
 		 696 aa  862    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  52.02 
 
 		 714 aa  683    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  53.36 
 
 		 712 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  61.02 
 
 		 706 aa  850    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  50 
 
 		 734 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  50.14 
 
 		 685 aa  626  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  48.3 
 
 		 708 aa  622  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  48.54 
 
 		 703 aa  621  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  49.71 
 
 		 694 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  49.72 
 
 		 709 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  47.03 
 
 		 717 aa  589  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  45 
 
 		 716 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  46.44 
 
 		 694 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  46.03 
 
 		 759 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  44.82 
 
 		 723 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  47.99 
 
 		 577 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  48.17 
 
 		 577 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  47.88 
 
 		 546 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  44.05 
 
 		 726 aa  488  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  43.59 
 
 		 715 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  43.2 
 
 		 694 aa  469  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  48.29 
 
 		 536 aa  469  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  43.92 
 
 		 582 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  43.05 
 
 		 528 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  37.58 
 
 		 636 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  36.21 
 
 		 615 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  34.76 
 
 		 654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  35.38 
 
 		 682 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  34.29 
 
 		 688 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  34.29 
 
 		 688 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  33 
 
 		 645 aa  295  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.47 
 
 		 683 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  34.87 
 
 		 690 aa  287  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  33.72 
 
 		 684 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  34.4 
 
 		 681 aa  284  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.72 
 
 		 684 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  32.39 
 
 		 658 aa  280  9e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  34.01 
 
 		 683 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  30.59 
 
 		 751 aa  264  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  33.93 
 
 		 679 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  31.98 
 
 		 667 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  33.63 
 
 		 687 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  32.77 
 
 		 687 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  33.89 
 
 		 680 aa  260  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  33.78 
 
 		 679 aa  253  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  32.54 
 
 		 689 aa  252  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  31.33 
 
 		 623 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  33.48 
 
 		 692 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  33.03 
 
 		 677 aa  244  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  31.47 
 
 		 740 aa  234  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  45.2 
 
 		 369 aa  225  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  30.7 
 
 		 765 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  30.32 
 
 		 709 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  32.32 
 
 		 754 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.71 
 
 		 690 aa  210  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  29.96 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  31.21 
 
 		 727 aa  209  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.37 
 
 		 662 aa  203  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  30.03 
 
 		 669 aa  198  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  72.85 
 
 		 172 aa  198  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  63.29 
 
 		 156 aa  195  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  26.71 
 
 		 729 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  26.48 
 
 		 626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  26.48 
 
 		 626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  26.48 
 
 		 626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  26.55 
 
 		 624 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  34.95 
 
 		 624 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  67.2 
 
 		 133 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  63.93 
 
 		 129 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  26.32 
 
 		 624 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  34.36 
 
 		 624 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  41.5 
 
 		 597 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  65.57 
 
 		 129 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  36.28 
 
 		 380 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  27.19 
 
 		 652 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  27.34 
 
 		 654 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  26.99 
 
 		 670 aa  148  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  26.74 
 
 		 654 aa  144  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  26.59 
 
 		 652 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  32.82 
 
 		 603 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  55.65 
 
 		 133 aa  126  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  32.53 
 
 		 595 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  32.32 
 
 		 603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  32.32 
 
 		 606 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  31.71 
 
 		 607 aa  120  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>