More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0315 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0315  nuclease  100 
 
 		 636 aa  1281    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  40 
 
 		 715 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  38.02 
 
 		 708 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  38.52 
 
 		 714 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  39.31 
 
 		 726 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  37.56 
 
 		 706 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  38.27 
 
 		 694 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  37.56 
 
 		 706 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  37.48 
 
 		 712 aa  379  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  37.58 
 
 		 717 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  39.1 
 
 		 685 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  36.69 
 
 		 714 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  39.08 
 
 		 703 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  40.19 
 
 		 682 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  37.16 
 
 		 734 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  38.8 
 
 		 687 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  38.31 
 
 		 687 aa  362  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 615 aa  361  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  39.63 
 
 		 683 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  38.59 
 
 		 684 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  36.63 
 
 		 709 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  35.68 
 
 		 708 aa  357  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  38.08 
 
 		 687 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  38.73 
 
 		 694 aa  354  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  39.38 
 
 		 681 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  36.59 
 
 		 711 aa  351  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  36.16 
 
 		 706 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  38.96 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  36.16 
 
 		 717 aa  346  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  37.33 
 
 		 709 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  39.35 
 
 		 683 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  37.58 
 
 		 703 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  35.45 
 
 		 714 aa  343  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  36.76 
 
 		 703 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  37.35 
 
 		 688 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  33.9 
 
 		 658 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  39.45 
 
 		 679 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  37.35 
 
 		 688 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  35.12 
 
 		 713 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  37.97 
 
 		 684 aa  340  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  35.56 
 
 		 694 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  36.31 
 
 		 716 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  38.77 
 
 		 677 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  35.34 
 
 		 696 aa  330  7e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  38.75 
 
 		 687 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  36.57 
 
 		 713 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  39.31 
 
 		 680 aa  327  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  37.95 
 
 		 679 aa  326  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  36.42 
 
 		 667 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  34.43 
 
 		 751 aa  318  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  37.86 
 
 		 687 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  37.97 
 
 		 689 aa  312  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  37.99 
 
 		 765 aa  308  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  36.95 
 
 		 740 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  35.69 
 
 		 759 aa  306  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  37.16 
 
 		 692 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  37.89 
 
 		 754 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  38.35 
 
 		 727 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  35.74 
 
 		 709 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  35.06 
 
 		 623 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  34.89 
 
 		 645 aa  293  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 723 aa  290  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  36.56 
 
 		 528 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  35.05 
 
 		 654 aa  273  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  36.43 
 
 		 582 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  34.49 
 
 		 577 aa  263  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  34.76 
 
 		 546 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  33.46 
 
 		 577 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  35.05 
 
 		 536 aa  250  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  30.34 
 
 		 669 aa  230  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  32.23 
 
 		 652 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  32.54 
 
 		 654 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  32.22 
 
 		 654 aa  217  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  31.9 
 
 		 652 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  30.66 
 
 		 624 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.7 
 
 		 662 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  30.66 
 
 		 624 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  29.49 
 
 		 626 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  29.49 
 
 		 626 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  29.49 
 
 		 626 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 690 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  31.68 
 
 		 670 aa  207  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  29.91 
 
 		 662 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  29.23 
 
 		 624 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  44.07 
 
 		 380 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  29.03 
 
 		 624 aa  194  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  44.04 
 
 		 597 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  29.64 
 
 		 595 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  28.18 
 
 		 729 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  31.36 
 
 		 660 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  32.77 
 
 		 660 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  30.2 
 
 		 603 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  37.5 
 
 		 607 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  37.15 
 
 		 606 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  37.15 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  29.17 
 
 		 603 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  36.15 
 
 		 369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  30.17 
 
 		 422 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1816  parB-like partition protein  35.34 
 
 		 576 aa  124  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.357609  normal  0.915413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  29.69 
 
 		 623 aa  115  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>