104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2346 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 536 aa  1070    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  70.58 
 
 		 687 aa  703    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  67.27 
 
 		 708 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  63.7 
 
 		 709 aa  686    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  70.2 
 
 		 687 aa  705    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  70.58 
 
 		 687 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  53.52 
 
 		 703 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  52.58 
 
 		 703 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  53.95 
 
 		 546 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  54 
 
 		 706 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  54 
 
 		 706 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  54.04 
 
 		 714 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  52.37 
 
 		 577 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  54.49 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  48.65 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  51.47 
 
 		 577 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  55.19 
 
 		 734 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  49.33 
 
 		 711 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  51.52 
 
 		 714 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  53.21 
 
 		 712 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  51.95 
 
 		 582 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  47.22 
 
 		 696 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  51.68 
 
 		 708 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  49.28 
 
 		 706 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  49.81 
 
 		 694 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  49.42 
 
 		 717 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  49.41 
 
 		 713 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  47.82 
 
 		 703 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  49.13 
 
 		 716 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  45.86 
 
 		 685 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  45.6 
 
 		 713 aa  430  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  48.99 
 
 		 709 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  46.84 
 
 		 726 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  44.59 
 
 		 528 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  42.91 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  44.29 
 
 		 723 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  45.25 
 
 		 694 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  42.8 
 
 		 694 aa  361  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  42.7 
 
 		 759 aa  360  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  36.11 
 
 		 636 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  34.8 
 
 		 615 aa  240  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  32.67 
 
 		 654 aa  223  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  50.45 
 
 		 369 aa  217  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.1 
 
 		 683 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  34.59 
 
 		 682 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  29.58 
 
 		 751 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  33.59 
 
 		 684 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  33.4 
 
 		 681 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  32.74 
 
 		 683 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  32.48 
 
 		 690 aa  200  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  32.72 
 
 		 688 aa  200  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  32.72 
 
 		 688 aa  200  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  28.93 
 
 		 658 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  31.64 
 
 		 677 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  32.36 
 
 		 689 aa  193  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  32.94 
 
 		 679 aa  193  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  32.56 
 
 		 684 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  33.08 
 
 		 680 aa  186  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  31.63 
 
 		 687 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  34.19 
 
 		 740 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  34.12 
 
 		 765 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  29.59 
 
 		 667 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  29.67 
 
 		 709 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  32.43 
 
 		 692 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  30.62 
 
 		 687 aa  170  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  30.88 
 
 		 727 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  30.24 
 
 		 679 aa  154  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  33.53 
 
 		 754 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  29.8 
 
 		 623 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  29.26 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  28.46 
 
 		 669 aa  143  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  27.65 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.4 
 
 		 654 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  26.87 
 
 		 729 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  26.95 
 
 		 670 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  27.59 
 
 		 652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  24.67 
 
 		 690 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  26.81 
 
 		 654 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  26.42 
 
 		 652 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  35.92 
 
 		 597 aa  94  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  23.75 
 
 		 626 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  23.75 
 
 		 626 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  27.52 
 
 		 595 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  23.75 
 
 		 626 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  23.91 
 
 		 624 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  22.98 
 
 		 624 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  23.86 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  31.46 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  30.52 
 
 		 623 aa  79.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0235  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.946889 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  23.71 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  33.62 
 
 		 607 aa  77  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  25.39 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  33.62 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  33.76 
 
 		 603 aa  73.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  33.94 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  33.03 
 
 		 606 aa  73.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  25.38 
 
 		 660 aa  71.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3852  hypothetical protein  31.62 
 
 		 560 aa  67  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921055  normal  0.646797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>