More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1277 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  74.78 
 
 		 684 aa  984    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  75.18 
 
 		 690 aa  1007    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  86.76 
 
 		 687 aa  1118    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  84.64 
 
 		 688 aa  1115    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 689 aa  1367    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  84.25 
 
 		 687 aa  1062    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  82.78 
 
 		 679 aa  1048    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  74.24 
 
 		 682 aa  1003    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  75.07 
 
 		 683 aa  1010    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  88.39 
 
 		 680 aa  1153    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  84.64 
 
 		 688 aa  1115    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  69.68 
 
 		 679 aa  862    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  71.89 
 
 		 681 aa  949    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  83.31 
 
 		 683 aa  1105    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  74.78 
 
 		 684 aa  1012    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  84.04 
 
 		 692 aa  1044    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  58.03 
 
 		 677 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  82.02 
 
 		 597 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  37.71 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  37.57 
 
 		 658 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  39.49 
 
 		 709 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  38.71 
 
 		 636 aa  339  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  37.93 
 
 		 740 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  39.04 
 
 		 765 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  40.15 
 
 		 754 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  36.98 
 
 		 703 aa  324  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  37.62 
 
 		 623 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  34.32 
 
 		 751 aa  310  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  36.15 
 
 		 715 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  35.06 
 
 		 687 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  36.65 
 
 		 687 aa  302  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  35 
 
 		 687 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  35.77 
 
 		 709 aa  300  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  35.08 
 
 		 708 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  35.69 
 
 		 711 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  36.77 
 
 		 615 aa  296  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  36.39 
 
 		 709 aa  296  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  35.26 
 
 		 714 aa  296  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  37.97 
 
 		 727 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  35.78 
 
 		 714 aa  291  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  33.24 
 
 		 706 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  33.24 
 
 		 706 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  35.12 
 
 		 654 aa  290  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  34.77 
 
 		 694 aa  289  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  34.94 
 
 		 685 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  35.11 
 
 		 708 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  34.71 
 
 		 694 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  34.71 
 
 		 713 aa  287  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  35.53 
 
 		 713 aa  283  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  34.67 
 
 		 714 aa  283  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  34.25 
 
 		 734 aa  279  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 645 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  33.92 
 
 		 712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  33.99 
 
 		 694 aa  275  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  34.98 
 
 		 703 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  35.13 
 
 		 706 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  32.77 
 
 		 717 aa  273  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  33.38 
 
 		 726 aa  269  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  34.29 
 
 		 703 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  33.48 
 
 		 696 aa  264  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  33.19 
 
 		 759 aa  257  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  32.99 
 
 		 717 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  32.34 
 
 		 716 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  32.05 
 
 		 669 aa  231  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  30.7 
 
 		 652 aa  229  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  31.23 
 
 		 723 aa  223  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  31.16 
 
 		 654 aa  220  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  30.46 
 
 		 652 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  30.03 
 
 		 654 aa  216  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  44.94 
 
 		 380 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  30.7 
 
 		 670 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 582 aa  203  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  33.51 
 
 		 577 aa  200  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  32.54 
 
 		 536 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  32.17 
 
 		 528 aa  193  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  33.64 
 
 		 577 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.03 
 
 		 662 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  30.53 
 
 		 662 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  32.18 
 
 		 546 aa  183  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  30.31 
 
 		 626 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  30.31 
 
 		 626 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  30.31 
 
 		 626 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.63 
 
 		 690 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  30.64 
 
 		 624 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  29.91 
 
 		 624 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  29.97 
 
 		 624 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  29.52 
 
 		 624 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.09 
 
 		 595 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  27.72 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  29.85 
 
 		 660 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  34.08 
 
 		 485 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  29.25 
 
 		 660 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  35.25 
 
 		 295 aa  117  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  34.39 
 
 		 603 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  35.31 
 
 		 607 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  25.06 
 
 		 422 aa  104  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  34.97 
 
 		 603 aa  104  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  35.31 
 
 		 606 aa  104  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  35.31 
 
 		 389 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  31.58 
 
 		 623 aa  102  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>