More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0053 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  79.86 
 
 		 422 aa  687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  90.98 
 
 		 654 aa  1210    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  100 
 
 		 652 aa  1340    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  91.26 
 
 		 652 aa  1224    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  95.4 
 
 		 654 aa  1266    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  54.01 
 
 		 669 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  41.68 
 
 		 670 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  30.63 
 
 		 683 aa  233  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  32.33 
 
 		 740 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  29.86 
 
 		 658 aa  225  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  30.78 
 
 		 690 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  31.03 
 
 		 681 aa  223  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  32.44 
 
 		 727 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  32.38 
 
 		 636 aa  220  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  31.66 
 
 		 682 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  30.12 
 
 		 688 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  30.12 
 
 		 688 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  32.11 
 
 		 765 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  29.24 
 
 		 684 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  29.68 
 
 		 751 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  32.42 
 
 		 615 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  31.38 
 
 		 709 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 645 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  29.32 
 
 		 684 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  30.43 
 
 		 667 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  31.75 
 
 		 683 aa  204  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  32.63 
 
 		 754 aa  203  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  30.46 
 
 		 689 aa  200  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  30.33 
 
 		 680 aa  200  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  29.75 
 
 		 715 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  28.61 
 
 		 687 aa  194  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  27.61 
 
 		 703 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  28.59 
 
 		 687 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  30.39 
 
 		 679 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  29.78 
 
 		 679 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  27.19 
 
 		 694 aa  180  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  27.26 
 
 		 708 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  27.33 
 
 		 709 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  29.17 
 
 		 687 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  28.85 
 
 		 734 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  27.99 
 
 		 623 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  30.71 
 
 		 692 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  28.93 
 
 		 687 aa  177  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  29.34 
 
 		 677 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  28.29 
 
 		 714 aa  171  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  26.97 
 
 		 726 aa  171  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  28.29 
 
 		 759 aa  170  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  30.47 
 
 		 662 aa  170  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  28.55 
 
 		 709 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  28.31 
 
 		 687 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  28.38 
 
 		 712 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  27.98 
 
 		 708 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  26.56 
 
 		 713 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  29.52 
 
 		 662 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  28.17 
 
 		 717 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  26.97 
 
 		 706 aa  163  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  26.97 
 
 		 706 aa  163  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  29.43 
 
 		 654 aa  163  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  28.14 
 
 		 714 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  27.99 
 
 		 703 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  26.86 
 
 		 711 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  27.39 
 
 		 716 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  28.49 
 
 		 713 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  27.45 
 
 		 703 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  28.21 
 
 		 694 aa  158  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  28.04 
 
 		 685 aa  157  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  27.49 
 
 		 694 aa  151  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  26.89 
 
 		 717 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  26.15 
 
 		 706 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  26.32 
 
 		 696 aa  147  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  26.95 
 
 		 528 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  27.23 
 
 		 714 aa  137  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  27.17 
 
 		 582 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  27.29 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  32.41 
 
 		 690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  27.08 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  25.23 
 
 		 723 aa  119  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  28.31 
 
 		 607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  27.86 
 
 		 624 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  28.38 
 
 		 606 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  26.95 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  25.8 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  25.8 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  25.8 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  26.57 
 
 		 624 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  27.56 
 
 		 624 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  24.57 
 
 		 623 aa  112  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  27.87 
 
 		 603 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  26.86 
 
 		 624 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  26.47 
 
 		 660 aa  110  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  27.46 
 
 		 660 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  27.7 
 
 		 603 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  26.38 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3852  hypothetical protein  28.64 
 
 		 560 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921055  normal  0.646797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  34.67 
 
 		 389 aa  99.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  31.32 
 
 		 595 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  32.63 
 
 		 485 aa  97.8  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  27.13 
 
 		 295 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  29.2 
 
 		 729 aa  94.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  34.16 
 
 		 597 aa  91.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>