65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7705 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  264  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  96.77 
 
 		 717 aa  243  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  72.31 
 
 		 716 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  63.16 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  64.62 
 
 		 723 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  64.66 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  63.91 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  63.71 
 
 		 714 aa  156  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  61.29 
 
 		 714 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  62.1 
 
 		 687 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  59.68 
 
 		 687 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  58.87 
 
 		 713 aa  140  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  58.87 
 
 		 687 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  58.87 
 
 		 685 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  58.06 
 
 		 734 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  58.87 
 
 		 708 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  59.68 
 
 		 713 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  60.5 
 
 		 709 aa  133  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  54.03 
 
 		 706 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  56.35 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  54.03 
 
 		 706 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  55.65 
 
 		 694 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  55.65 
 
 		 712 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  58.06 
 
 		 708 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  55.65 
 
 		 714 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  58.68 
 
 		 703 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  50.81 
 
 		 694 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  54.55 
 
 		 709 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  58.68 
 
 		 703 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  54.84 
 
 		 706 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  55.65 
 
 		 717 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  52.03 
 
 		 759 aa  121  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  53.23 
 
 		 711 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  51.61 
 
 		 696 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  55.08 
 
 		 703 aa  117  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  53.6 
 
 		 172 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2279  hypothetical protein  54.55 
 
 		 134 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.196831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7316  putative ParB-like nuclease  40.98 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  39.62 
 
 		 690 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  33.94 
 
 		 636 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  38.05 
 
 		 485 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  28.8 
 
 		 624 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  41.44 
 
 		 662 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  39.47 
 
 		 662 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  36.94 
 
 		 688 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  36.94 
 
 		 688 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  37.14 
 
 		 658 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  33.04 
 
 		 615 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  38.74 
 
 		 683 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  27.2 
 
 		 624 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  37.17 
 
 		 694 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  27.2 
 
 		 626 aa  43.9  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  27.2 
 
 		 626 aa  43.9  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  27.2 
 
 		 626 aa  43.9  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  39.09 
 
 		 682 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  38.74 
 
 		 690 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  36.94 
 
 		 683 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  29.09 
 
 		 624 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  29.09 
 
 		 624 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  37.84 
 
 		 681 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  33.33 
 
 		 667 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  35.4 
 
 		 729 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  41.67 
 
 		 684 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  36.94 
 
 		 680 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  36.94 
 
 		 687 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>