95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7316 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7316  putative ParB-like nuclease  100 
 
 		 146 aa  299  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  82.76 
 
 		 726 aa  196  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  81.51 
 
 		 694 aa  193  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  68.75 
 
 		 715 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0406  nuclease  50.72 
 
 		 325 aa  125  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  47.24 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 645 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  44.92 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  42.73 
 
 		 708 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  41.98 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  45.28 
 
 		 712 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  44.95 
 
 		 714 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  45.28 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  42.02 
 
 		 687 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  43.52 
 
 		 708 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  39.84 
 
 		 717 aa  69.3  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  42.73 
 
 		 706 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  42.73 
 
 		 706 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  44.14 
 
 		 624 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  42.59 
 
 		 687 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  44.14 
 
 		 624 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  42.73 
 
 		 711 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  43.24 
 
 		 713 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  42.24 
 
 		 709 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  40.87 
 
 		 709 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  44.44 
 
 		 654 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  41.8 
 
 		 714 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  42.86 
 
 		 714 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 687 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  44.14 
 
 		 694 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  43.75 
 
 		 694 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  41.27 
 
 		 734 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  40.8 
 
 		 713 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  40.37 
 
 		 662 aa  63.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  39.62 
 
 		 703 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  44.14 
 
 		 624 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  44.14 
 
 		 624 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  40.98 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  44.04 
 
 		 685 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  43.24 
 
 		 626 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  43.24 
 
 		 626 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  43.24 
 
 		 626 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  42.45 
 
 		 703 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  40.91 
 
 		 759 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  41.51 
 
 		 703 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  42.73 
 
 		 690 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  40.37 
 
 		 662 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  38.53 
 
 		 696 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  40.87 
 
 		 658 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  40.74 
 
 		 615 aa  58.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  43.4 
 
 		 706 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  39.62 
 
 		 754 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  39.45 
 
 		 690 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  35.19 
 
 		 709 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  36.03 
 
 		 682 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  40.74 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  39.45 
 
 		 683 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  35.29 
 
 		 681 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  32.85 
 
 		 684 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  32.58 
 
 		 654 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  32.85 
 
 		 684 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  33.81 
 
 		 652 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  37.27 
 
 		 688 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  37.27 
 
 		 688 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  38.89 
 
 		 751 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  36.79 
 
 		 727 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  35.16 
 
 		 652 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  37.74 
 
 		 765 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2279  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.196831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  39.09 
 
 		 687 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  37.62 
 
 		 740 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  42.86 
 
 		 669 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  35.19 
 
 		 654 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  39.25 
 
 		 636 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  35.09 
 
 		 667 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  37.27 
 
 		 680 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  35.19 
 
 		 317 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  33.04 
 
 		 310 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  38.18 
 
 		 683 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  37.27 
 
 		 679 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  36.7 
 
 		 687 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  34.26 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  40.48 
 
 		 670 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  32.73 
 
 		 296 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  33.8 
 
 		 729 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 311 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  34.92 
 
 		 717 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  31.37 
 
 		 612 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.65 
 
 		 677 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  30 
 
 		 298 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  31.71 
 
 		 314 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  30.15 
 
 		 301 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4477  plasmid partitioning protein  30.39 
 
 		 560 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0558103  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3389  hypothetical protein  31.86 
 
 		 296 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39686  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  30.15 
 
 		 296 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>