68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0406 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0406  nuclease  100 
 
 		 325 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0786  hypothetical protein  37.57 
 
 		 565 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.114287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7316  putative ParB-like nuclease  50.72 
 
 		 146 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  42.93 
 
 		 694 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  56.03 
 
 		 726 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  50.36 
 
 		 715 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  35.34 
 
 		 708 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  34.76 
 
 		 706 aa  73.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  34.76 
 
 		 706 aa  73.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  37.02 
 
 		 708 aa  72.8  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  34.05 
 
 		 714 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  48.25 
 
 		 712 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  45.22 
 
 		 615 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  37.06 
 
 		 709 aa  69.7  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  36.47 
 
 		 687 aa  69.7  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  35.88 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  34.81 
 
 		 687 aa  66.2  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  35.19 
 
 		 734 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  37.14 
 
 		 714 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 654 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  41.44 
 
 		 645 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  31 
 
 		 709 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  42.11 
 
 		 156 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  35.16 
 
 		 713 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  35.84 
 
 		 711 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  34.1 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  42.48 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  41.32 
 
 		 658 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  32.78 
 
 		 709 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  34.71 
 
 		 703 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  36 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  35.88 
 
 		 703 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  32.81 
 
 		 713 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  31.77 
 
 		 624 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  38.06 
 
 		 662 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  38.37 
 
 		 636 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  34.48 
 
 		 624 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  34.48 
 
 		 624 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  33.15 
 
 		 759 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  31.77 
 
 		 626 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  31.77 
 
 		 626 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  31.77 
 
 		 626 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  43.27 
 
 		 129 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  36.09 
 
 		 662 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  33.92 
 
 		 696 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  31.51 
 
 		 694 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  31.25 
 
 		 624 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  32.54 
 
 		 703 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  42.31 
 
 		 129 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  40.48 
 
 		 133 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  41.73 
 
 		 172 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  41.96 
 
 		 690 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.91 
 
 		 683 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  33.12 
 
 		 751 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  34.91 
 
 		 690 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  34.32 
 
 		 681 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  34.57 
 
 		 684 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  32.57 
 
 		 717 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  35.5 
 
 		 682 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  38.05 
 
 		 717 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  33.14 
 
 		 688 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  33.14 
 
 		 688 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  37.19 
 
 		 654 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  32.74 
 
 		 706 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  38.02 
 
 		 652 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  35.45 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  37.3 
 
 		 652 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.33 
 
 		 684 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>