178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6935 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  100 
 
 		 709 aa  1415    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  38.95 
 
 		 751 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  37.96 
 
 		 740 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  37.11 
 
 		 658 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  39.41 
 
 		 683 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  40.45 
 
 		 681 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  38.61 
 
 		 684 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  40.03 
 
 		 727 aa  363  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  40.16 
 
 		 765 aa  363  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  38.12 
 
 		 682 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  40.31 
 
 		 754 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  37.71 
 
 		 690 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  39.88 
 
 		 683 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  39.02 
 
 		 680 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  38.52 
 
 		 687 aa  353  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  38.35 
 
 		 684 aa  350  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  38.91 
 
 		 689 aa  344  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  38.33 
 
 		 688 aa  343  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  38.33 
 
 		 688 aa  343  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  37.39 
 
 		 679 aa  330  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  38.54 
 
 		 679 aa  330  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  36.89 
 
 		 677 aa  320  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  38.67 
 
 		 692 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  37.99 
 
 		 687 aa  316  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  36.68 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  34.8 
 
 		 667 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  34.15 
 
 		 685 aa  294  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  33.48 
 
 		 708 aa  291  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  35.18 
 
 		 615 aa  290  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  34.67 
 
 		 696 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  33.12 
 
 		 715 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  32.27 
 
 		 706 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  32.27 
 
 		 706 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  32.92 
 
 		 726 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  32.87 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  33.13 
 
 		 654 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  33.78 
 
 		 734 aa  271  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  31.78 
 
 		 714 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  34.14 
 
 		 703 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  34.35 
 
 		 709 aa  269  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  32.64 
 
 		 712 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  32.12 
 
 		 716 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  30.39 
 
 		 714 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  31.89 
 
 		 694 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  32.51 
 
 		 694 aa  261  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  31.8 
 
 		 708 aa  261  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  33.49 
 
 		 687 aa  259  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  32.47 
 
 		 703 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  30.88 
 
 		 714 aa  257  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  32.13 
 
 		 687 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  30.46 
 
 		 717 aa  254  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  32.67 
 
 		 706 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 687 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  32.57 
 
 		 711 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 645 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  30.43 
 
 		 703 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  31.01 
 
 		 709 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  32.88 
 
 		 694 aa  243  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  30.8 
 
 		 759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  29.78 
 
 		 717 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  29.56 
 
 		 723 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  31.66 
 
 		 669 aa  230  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  31.34 
 
 		 654 aa  230  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  31.54 
 
 		 654 aa  230  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  30.95 
 
 		 623 aa  230  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  31.7 
 
 		 652 aa  229  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  31.23 
 
 		 713 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  31.27 
 
 		 652 aa  228  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  30.92 
 
 		 582 aa  218  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  30.51 
 
 		 670 aa  207  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  30.41 
 
 		 577 aa  207  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  31.55 
 
 		 528 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  28.75 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  30.11 
 
 		 536 aa  191  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.81 
 
 		 690 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  30.02 
 
 		 577 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  28.21 
 
 		 624 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.31 
 
 		 662 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  27.56 
 
 		 624 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  30.26 
 
 		 662 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  37.5 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  26.5 
 
 		 626 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  26.5 
 
 		 626 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  26.5 
 
 		 626 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  28.51 
 
 		 729 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  26.99 
 
 		 624 aa  160  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  36 
 
 		 380 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  26.91 
 
 		 624 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  29.3 
 
 		 660 aa  112  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  35.52 
 
 		 606 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  35.52 
 
 		 607 aa  104  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  29.25 
 
 		 369 aa  102  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  34.52 
 
 		 603 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  34.52 
 
 		 603 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  35.17 
 
 		 389 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  26.49 
 
 		 595 aa  99  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  26.06 
 
 		 422 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  30.98 
 
 		 660 aa  97.8  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  29.82 
 
 		 623 aa  92  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  30.35 
 
 		 295 aa  91.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>