228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1660 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  100 
 
 		 389 aa  763    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  96.78 
 
 		 603 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  98.39 
 
 		 606 aa  713    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  97.32 
 
 		 607 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  96.25 
 
 		 603 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3852  hypothetical protein  92.42 
 
 		 560 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921055  normal  0.646797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  40.11 
 
 		 623 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  38.27 
 
 		 687 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  33.08 
 
 		 726 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  37.24 
 
 		 687 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  35.84 
 
 		 712 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  34.7 
 
 		 636 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  35.28 
 
 		 714 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  32.99 
 
 		 703 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  35.9 
 
 		 687 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  35.4 
 
 		 703 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  37.56 
 
 		 714 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  35.9 
 
 		 714 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  35.05 
 
 		 703 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  34.35 
 
 		 708 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  35.99 
 
 		 713 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  35.04 
 
 		 685 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  33.68 
 
 		 711 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  35.14 
 
 		 734 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  33.74 
 
 		 706 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  33.74 
 
 		 706 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  35.28 
 
 		 708 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  33.68 
 
 		 709 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  34.79 
 
 		 709 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  34.17 
 
 		 694 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  33.65 
 
 		 690 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  35.74 
 
 		 615 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  33.92 
 
 		 694 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  33.33 
 
 		 717 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  33.25 
 
 		 723 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  32.74 
 
 		 696 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  34.58 
 
 		 670 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  38.55 
 
 		 759 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  33.71 
 
 		 624 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  33.09 
 
 		 626 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  33.09 
 
 		 626 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  33.09 
 
 		 626 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  35.65 
 
 		 662 aa  126  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  31.01 
 
 		 713 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  33.5 
 
 		 716 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  32.59 
 
 		 624 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  35.65 
 
 		 662 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 645 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  33.33 
 
 		 624 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  33.33 
 
 		 624 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  32.85 
 
 		 669 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  37.37 
 
 		 690 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  31.19 
 
 		 717 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.63 
 
 		 683 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  33.42 
 
 		 740 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 706 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  31.82 
 
 		 729 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  36.5 
 
 		 652 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  31.83 
 
 		 751 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  36.73 
 
 		 754 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  29.95 
 
 		 715 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  36.13 
 
 		 654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  39.16 
 
 		 577 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  36.95 
 
 		 681 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.88 
 
 		 684 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  35.54 
 
 		 688 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  35.54 
 
 		 688 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  36.13 
 
 		 654 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  37.59 
 
 		 679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  34.48 
 
 		 667 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  34.07 
 
 		 684 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  30.13 
 
 		 694 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  31.05 
 
 		 654 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  35.69 
 
 		 679 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  34.67 
 
 		 652 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  32.08 
 
 		 765 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  34.83 
 
 		 709 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  34.62 
 
 		 687 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  35.76 
 
 		 680 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  35.23 
 
 		 682 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  32.64 
 
 		 683 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  36.46 
 
 		 692 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  31.87 
 
 		 689 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  35.5 
 
 		 577 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  36.13 
 
 		 727 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  39.89 
 
 		 623 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  33.81 
 
 		 687 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  31.5 
 
 		 658 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  32.43 
 
 		 582 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  40 
 
 		 597 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 660 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.14 
 
 		 677 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.68 
 
 		 595 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  40.45 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  34.75 
 
 		 546 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  32.54 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  34.4 
 
 		 536 aa  86.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  31.8 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  29.59 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  29.93 
 
 		 660 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>