241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3808 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3808  nuclease  100 
 
 		 694 aa  1400    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  60.43 
 
 		 715 aa  794    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  75.08 
 
 		 726 aa  976    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  64.25 
 
 		 528 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  46.87 
 
 		 708 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  47.2 
 
 		 709 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  46.32 
 
 		 687 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  42.9 
 
 		 711 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  44.73 
 
 		 703 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  43.18 
 
 		 703 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  42.92 
 
 		 717 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  45.6 
 
 		 687 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  43.85 
 
 		 706 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  45.41 
 
 		 687 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  42.31 
 
 		 714 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  42.04 
 
 		 703 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  42.46 
 
 		 694 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  42.1 
 
 		 712 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  42.38 
 
 		 714 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  43.19 
 
 		 709 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  41.41 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  43.63 
 
 		 685 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  41.36 
 
 		 708 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  41.19 
 
 		 706 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  41.19 
 
 		 706 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  41.88 
 
 		 713 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  41.5 
 
 		 696 aa  445  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  42.17 
 
 		 734 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  41.9 
 
 		 717 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  41.68 
 
 		 713 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  40.74 
 
 		 716 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  44.51 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  39.2 
 
 		 759 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  41.21 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  43.54 
 
 		 577 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  43.75 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  39.2 
 
 		 694 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  40.41 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  38.73 
 
 		 636 aa  363  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  37.61 
 
 		 723 aa  356  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  35.19 
 
 		 615 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 645 aa  313  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  35.56 
 
 		 654 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  36.14 
 
 		 683 aa  301  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  35.96 
 
 		 682 aa  299  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  35.22 
 
 		 683 aa  294  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  35.66 
 
 		 688 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  35.66 
 
 		 688 aa  293  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  33.28 
 
 		 658 aa  289  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  35.4 
 
 		 667 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  36.74 
 
 		 679 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  35.1 
 
 		 690 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  34.24 
 
 		 684 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  35.36 
 
 		 679 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  36.39 
 
 		 687 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  34.28 
 
 		 681 aa  270  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  36.34 
 
 		 680 aa  270  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.63 
 
 		 684 aa  268  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.41 
 
 		 677 aa  266  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  30.96 
 
 		 751 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  34.95 
 
 		 687 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  32.71 
 
 		 709 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  34.25 
 
 		 689 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  36.23 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  34.03 
 
 		 765 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  31.49 
 
 		 740 aa  241  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  30.18 
 
 		 623 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  32.26 
 
 		 727 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  34.28 
 
 		 754 aa  218  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  29.07 
 
 		 669 aa  207  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7316  putative ParB-like nuclease  81.51 
 
 		 146 aa  193  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  28.53 
 
 		 652 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  28.23 
 
 		 654 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.01 
 
 		 654 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.34 
 
 		 690 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  29.49 
 
 		 662 aa  180  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.13 
 
 		 662 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  27.49 
 
 		 652 aa  178  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  40.65 
 
 		 369 aa  172  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  26.92 
 
 		 624 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  26.86 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  26.92 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  27.01 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  26.9 
 
 		 626 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  26.9 
 
 		 626 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  26.9 
 
 		 626 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  40.21 
 
 		 597 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  27.35 
 
 		 670 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  35.61 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  28.68 
 
 		 660 aa  132  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  26.35 
 
 		 729 aa  127  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  27.76 
 
 		 660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0406  nuclease  42.93 
 
 		 325 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  31.7 
 
 		 595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  31.83 
 
 		 295 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0235  hypothetical protein  71.83 
 
 		 106 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.946889 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  31.92 
 
 		 603 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  31.92 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  31.6 
 
 		 607 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  31.6 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>