244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2520 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  55.13 
 
 		 703 aa  725    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  54.67 
 
 		 713 aa  720    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  50 
 
 		 703 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  50.22 
 
 		 703 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  100 
 
 		 694 aa  1385    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  62.77 
 
 		 713 aa  856    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  51.33 
 
 		 714 aa  623  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  51.03 
 
 		 714 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  49.07 
 
 		 714 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  50.3 
 
 		 709 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  49.93 
 
 		 712 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  47.78 
 
 		 706 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  49.55 
 
 		 708 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  47.78 
 
 		 706 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  50.51 
 
 		 734 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  48.89 
 
 		 708 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  49.4 
 
 		 685 aa  595  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  47.31 
 
 		 711 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  48.72 
 
 		 706 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  47.69 
 
 		 694 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  46.81 
 
 		 717 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  46.44 
 
 		 717 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  47.63 
 
 		 687 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  46.68 
 
 		 696 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  47.35 
 
 		 687 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  47.6 
 
 		 687 aa  561  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  47.85 
 
 		 709 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  44.8 
 
 		 716 aa  529  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  43.88 
 
 		 759 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  42.66 
 
 		 723 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  46.85 
 
 		 577 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  48.5 
 
 		 577 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  46.08 
 
 		 582 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  43.42 
 
 		 546 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  37.75 
 
 		 715 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  38.65 
 
 		 726 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  38.65 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  43.39 
 
 		 536 aa  362  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  35.56 
 
 		 636 aa  344  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  39.62 
 
 		 528 aa  323  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  37.82 
 
 		 682 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  36.01 
 
 		 681 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  34.94 
 
 		 615 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  36.26 
 
 		 688 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  36.26 
 
 		 688 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  36.43 
 
 		 683 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  35.99 
 
 		 684 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  36.01 
 
 		 683 aa  297  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  35.06 
 
 		 684 aa  294  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  35.37 
 
 		 690 aa  286  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  36.05 
 
 		 679 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  36.46 
 
 		 680 aa  277  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  35.86 
 
 		 687 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  32.69 
 
 		 654 aa  273  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  35.29 
 
 		 687 aa  272  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  32.42 
 
 		 658 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  36.8 
 
 		 677 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  34.71 
 
 		 689 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 645 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  36.08 
 
 		 679 aa  260  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  34.23 
 
 		 692 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  31.85 
 
 		 667 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  33.62 
 
 		 740 aa  244  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  29.12 
 
 		 751 aa  244  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  32.52 
 
 		 709 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  33.18 
 
 		 765 aa  233  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  33.12 
 
 		 754 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  31.74 
 
 		 623 aa  220  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  29.38 
 
 		 690 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  30.56 
 
 		 727 aa  210  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  43.6 
 
 		 369 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  30.11 
 
 		 669 aa  194  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  30.67 
 
 		 662 aa  191  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  62.66 
 
 		 156 aa  188  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.31 
 
 		 662 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  29.01 
 
 		 626 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  29.01 
 
 		 626 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  29.01 
 
 		 626 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  28.35 
 
 		 624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  72.58 
 
 		 133 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  28.09 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  28.13 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  28.11 
 
 		 624 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  27.58 
 
 		 654 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  28.64 
 
 		 652 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  27.38 
 
 		 729 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  64.8 
 
 		 129 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  42.41 
 
 		 597 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  67.83 
 
 		 129 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  27.86 
 
 		 654 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  27.27 
 
 		 652 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  58.17 
 
 		 172 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  37.77 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  27.1 
 
 		 670 aa  143  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  55.65 
 
 		 133 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  32.53 
 
 		 595 aa  127  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  38.23 
 
 		 606 aa  125  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  38.23 
 
 		 607 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  37.76 
 
 		 389 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  37.5 
 
 		 603 aa  120  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>