More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0771 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  59.4 
 
 
714 aa  760    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  59.94 
 
 
734 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  55.32 
 
 
709 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  57.19 
 
 
711 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  67.15 
 
 
687 aa  903    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  68.53 
 
 
687 aa  916    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  57.33 
 
 
706 aa  753    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  54.41 
 
 
717 aa  665    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  57.33 
 
 
706 aa  753    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  52.22 
 
 
703 aa  667    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  55.31 
 
 
713 aa  688    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  53.78 
 
 
694 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  62.08 
 
 
703 aa  791    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  61.65 
 
 
703 aa  787    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  90.54 
 
 
709 aa  1258    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  55.31 
 
 
685 aa  725    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  60.79 
 
 
714 aa  816    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  67.53 
 
 
687 aa  922    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  56.13 
 
 
706 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  60.12 
 
 
712 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  53.64 
 
 
713 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  100 
 
 
708 aa  1421    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  58.14 
 
 
708 aa  725    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  55.12 
 
 
717 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  52.3 
 
 
696 aa  676    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  61.64 
 
 
714 aa  768    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  63.36 
 
 
536 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  51.78 
 
 
716 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  49.03 
 
 
694 aa  596  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  45.74 
 
 
759 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  45.87 
 
 
723 aa  555  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  55.04 
 
 
577 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  52.95 
 
 
546 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  51.46 
 
 
577 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  46.66 
 
 
726 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  45.74 
 
 
694 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  51.86 
 
 
582 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  44.92 
 
 
715 aa  511  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  46.25 
 
 
528 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  35.68 
 
 
636 aa  357  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  36.96 
 
 
615 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  36.18 
 
 
688 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  36.18 
 
 
688 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  35.91 
 
 
683 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  36.09 
 
 
682 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  35.41 
 
 
684 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  36.11 
 
 
690 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  35.67 
 
 
681 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  35.73 
 
 
683 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  32.25 
 
 
658 aa  303  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  36.49 
 
 
679 aa  299  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  35.29 
 
 
684 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  36.59 
 
 
680 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  34.88 
 
 
645 aa  296  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  34.17 
 
 
654 aa  291  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  36.17 
 
 
687 aa  291  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.52 
 
 
677 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  35.82 
 
 
687 aa  282  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  34.86 
 
 
689 aa  279  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  33.43 
 
 
667 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  35.23 
 
 
740 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  34.91 
 
 
765 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  84.62 
 
 
156 aa  263  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  30.9 
 
 
751 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  34.15 
 
 
679 aa  259  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  33.74 
 
 
692 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  52.44 
 
 
369 aa  249  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  35.71 
 
 
754 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  31.85 
 
 
709 aa  240  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  32.84 
 
 
662 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  32.71 
 
 
662 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  31.76 
 
 
727 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  30.02 
 
 
669 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  29.73 
 
 
690 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  32.98 
 
 
623 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.74 
 
 
654 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  77.42 
 
 
133 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  27.89 
 
 
652 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  27.35 
 
 
654 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  75.83 
 
 
129 aa  181  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  26.29 
 
 
626 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  26.29 
 
 
626 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  26.29 
 
 
626 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  27.22 
 
 
652 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  28.85 
 
 
729 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  26.53 
 
 
624 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  26.72 
 
 
624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  74.17 
 
 
129 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  27.16 
 
 
624 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  64 
 
 
172 aa  167  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  26.84 
 
 
624 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  28.79 
 
 
670 aa  161  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  45.33 
 
 
597 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  58.87 
 
 
133 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  30.45 
 
 
623 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.85 
 
 
595 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  27.62 
 
 
660 aa  127  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  32.82 
 
 
607 aa  128  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  26.09 
 
 
660 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  33.93 
 
 
606 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>