More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4956 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  72.85 
 
 		 717 aa  223  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  69.74 
 
 		 696 aa  221  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  67.11 
 
 		 713 aa  205  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  68.21 
 
 		 706 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  64.24 
 
 		 708 aa  193  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  63.58 
 
 		 711 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  64.71 
 
 		 713 aa  190  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  64.24 
 
 		 714 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  66.44 
 
 		 709 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  66.67 
 
 		 703 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  64.24 
 
 		 712 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  63.16 
 
 		 714 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  64 
 
 		 708 aa  184  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  61.84 
 
 		 706 aa  184  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  61.84 
 
 		 706 aa  184  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  63.58 
 
 		 687 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  65.31 
 
 		 703 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  61.18 
 
 		 714 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  62.91 
 
 		 687 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  62.91 
 
 		 687 aa  181  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  63.45 
 
 		 709 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  61.44 
 
 		 685 aa  179  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  60.26 
 
 		 734 aa  178  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  62.59 
 
 		 759 aa  174  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  58.82 
 
 		 156 aa  174  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  60.27 
 
 		 703 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  59.87 
 
 		 694 aa  171  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  58.17 
 
 		 694 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  55.84 
 
 		 717 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  62.9 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  62.3 
 
 		 129 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  64.66 
 
 		 129 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  47.2 
 
 		 716 aa  127  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  45.96 
 
 		 723 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  53.6 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2279  hypothetical protein  61.84 
 
 		 134 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.196831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  44.29 
 
 		 694 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  44.53 
 
 		 636 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  44.53 
 
 		 658 aa  95.9  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  40.28 
 
 		 690 aa  95.5  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  41.55 
 
 		 615 aa  95.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  42.45 
 
 		 688 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  42.45 
 
 		 688 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  42.07 
 
 		 726 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  44.6 
 
 		 690 aa  89  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  44.6 
 
 		 683 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  46.51 
 
 		 681 aa  88.6  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  44.6 
 
 		 682 aa  87.8  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  45.74 
 
 		 684 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  45.32 
 
 		 683 aa  87.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  45.74 
 
 		 684 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  45.32 
 
 		 679 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  45.32 
 
 		 687 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  45.32 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  45.32 
 
 		 680 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  39.86 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  41.84 
 
 		 667 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  45.26 
 
 		 679 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 645 aa  77.4  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  45.32 
 
 		 689 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  37.86 
 
 		 662 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  40.15 
 
 		 754 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  39.29 
 
 		 662 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  41.73 
 
 		 485 aa  75.1  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  45 
 
 		 692 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  38.85 
 
 		 727 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  37.68 
 
 		 765 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  36.23 
 
 		 654 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  34.85 
 
 		 281 aa  67  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  34.78 
 
 		 626 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  34.78 
 
 		 626 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  39.68 
 
 		 669 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0406  nuclease  42.06 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  33.1 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  34.78 
 
 		 626 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  33.82 
 
 		 624 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  33.1 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  33.82 
 
 		 624 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  34.06 
 
 		 624 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  35.56 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 313 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  31.34 
 
 		 294 aa  63.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7316  putative ParB-like nuclease  40.74 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  34.01 
 
 		 654 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  31.34 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  36.96 
 
 		 740 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  35.46 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  36.62 
 
 		 709 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  32.61 
 
 		 624 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  34.69 
 
 		 652 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  31.78 
 
 		 303 aa  61.6  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  41.86 
 
 		 677 aa  61.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  33.33 
 
 		 652 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1816  parB-like partition protein  33.58 
 
 		 576 aa  60.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.357609  normal  0.915413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  34.56 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  34.33 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  35 
 
 		 785 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  36.67 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>