More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5564 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  55.17 
 
 		 709 aa  738    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 759 aa  1514    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  47.48 
 
 		 714 aa  595  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  47.6 
 
 		 703 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  48.3 
 
 		 709 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  46.08 
 
 		 711 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  47.61 
 
 		 703 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  47.79 
 
 		 708 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  45.95 
 
 		 706 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  45.95 
 
 		 706 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  45.42 
 
 		 717 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  46.61 
 
 		 714 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  46.4 
 
 		 714 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  46.45 
 
 		 706 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  47.54 
 
 		 694 aa  555  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  47.87 
 
 		 712 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  48.15 
 
 		 687 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  46.89 
 
 		 687 aa  548  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  44.9 
 
 		 696 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  47.4 
 
 		 687 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  44.84 
 
 		 713 aa  539  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  44.62 
 
 		 713 aa  538  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  46.49 
 
 		 708 aa  538  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  44.59 
 
 		 703 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  46.81 
 
 		 734 aa  532  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  44.52 
 
 		 717 aa  528  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  44.13 
 
 		 685 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  43.6 
 
 		 694 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  41.17 
 
 		 716 aa  492  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  40.7 
 
 		 723 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  38.21 
 
 		 715 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  42.5 
 
 		 577 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  39.05 
 
 		 726 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  39.5 
 
 		 694 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  42.69 
 
 		 577 aa  389  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  41.76 
 
 		 582 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  39.6 
 
 		 546 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  42.65 
 
 		 536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  40.56 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  35.69 
 
 		 636 aa  313  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  32.79 
 
 		 615 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  31.81 
 
 		 658 aa  299  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 645 aa  287  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  33.38 
 
 		 688 aa  270  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  33.38 
 
 		 688 aa  270  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.99 
 
 		 677 aa  266  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  34.62 
 
 		 681 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  33.11 
 
 		 682 aa  264  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  33.28 
 
 		 654 aa  260  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  33.71 
 
 		 684 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.76 
 
 		 684 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  33.97 
 
 		 683 aa  257  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  33.43 
 
 		 679 aa  253  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  32.93 
 
 		 683 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  32.5 
 
 		 667 aa  251  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  32.66 
 
 		 679 aa  251  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  33.63 
 
 		 690 aa  250  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  33.66 
 
 		 680 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  34.07 
 
 		 687 aa  243  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  33.29 
 
 		 689 aa  238  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  30.58 
 
 		 709 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  32.66 
 
 		 692 aa  225  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  27.48 
 
 		 751 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  31.54 
 
 		 765 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  31.51 
 
 		 623 aa  211  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  30.99 
 
 		 740 aa  210  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  44.76 
 
 		 369 aa  204  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  30.84 
 
 		 727 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  31.25 
 
 		 754 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.53 
 
 		 690 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  57.32 
 
 		 156 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  28.82 
 
 		 669 aa  178  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  37.54 
 
 		 624 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  33.68 
 
 		 624 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  38.63 
 
 		 626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  38.63 
 
 		 626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  38.63 
 
 		 626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  36.34 
 
 		 687 aa  174  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  32.92 
 
 		 624 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  32.9 
 
 		 624 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  38.7 
 
 		 662 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.67 
 
 		 654 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  40.35 
 
 		 662 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  27.87 
 
 		 652 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  62.59 
 
 		 172 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  27.03 
 
 		 729 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  62.18 
 
 		 129 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  42.45 
 
 		 597 aa  140  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  56.91 
 
 		 133 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  32.01 
 
 		 654 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  31.93 
 
 		 652 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  27.25 
 
 		 623 aa  134  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  55.74 
 
 		 129 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  31.18 
 
 		 670 aa  126  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  37.72 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  52.03 
 
 		 133 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  31.99 
 
 		 595 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  38.79 
 
 		 607 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  37.86 
 
 		 603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  38.55 
 
 		 389 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>