105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7310 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  100 
 
 		 528 aa  1071    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  64.25 
 
 		 694 aa  641    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  60.98 
 
 		 726 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  54.42 
 
 		 715 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  46.93 
 
 		 709 aa  425  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  46.25 
 
 		 708 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  44.4 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  44.22 
 
 		 706 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  43.54 
 
 		 711 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  45.04 
 
 		 687 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  44.72 
 
 		 703 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  42.88 
 
 		 687 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  44.4 
 
 		 687 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  41.91 
 
 		 714 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  43.39 
 
 		 709 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  42.97 
 
 		 703 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  42.47 
 
 		 703 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  42.72 
 
 		 714 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  43.05 
 
 		 717 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  42.74 
 
 		 696 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  41.84 
 
 		 714 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  41.12 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  41.29 
 
 		 712 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  41.9 
 
 		 685 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  42.67 
 
 		 577 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  41.1 
 
 		 706 aa  357  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  41.1 
 
 		 706 aa  357  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  41.33 
 
 		 713 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  42.37 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  41.47 
 
 		 708 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  42.03 
 
 		 694 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  42.15 
 
 		 717 aa  340  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  41.11 
 
 		 716 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  39.56 
 
 		 713 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  41.07 
 
 		 582 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  40.37 
 
 		 734 aa  336  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  40.75 
 
 		 759 aa  334  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  40.04 
 
 		 723 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  39.62 
 
 		 694 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  36.56 
 
 		 636 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  34.38 
 
 		 615 aa  257  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  31.15 
 
 		 658 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  35.86 
 
 		 654 aa  223  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  33.08 
 
 		 667 aa  216  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  32.77 
 
 		 683 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  33.14 
 
 		 677 aa  206  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  32.76 
 
 		 682 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 645 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  33.85 
 
 		 681 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  31.7 
 
 		 688 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  31.7 
 
 		 688 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  31.89 
 
 		 684 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  33.08 
 
 		 690 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  32.43 
 
 		 679 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  32.16 
 
 		 683 aa  193  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  30 
 
 		 623 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.46 
 
 		 684 aa  187  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  33.58 
 
 		 679 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  31.93 
 
 		 680 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  31.34 
 
 		 709 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  31.12 
 
 		 689 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  27.27 
 
 		 751 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  31.59 
 
 		 687 aa  180  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  30.62 
 
 		 740 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  42.61 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  30.75 
 
 		 687 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  31.05 
 
 		 692 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  31.67 
 
 		 765 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  28.1 
 
 		 669 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  27.46 
 
 		 652 aa  143  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  27.46 
 
 		 654 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  26.63 
 
 		 652 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  27.12 
 
 		 654 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  27.96 
 
 		 727 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  27.73 
 
 		 662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  26.87 
 
 		 662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  30.77 
 
 		 754 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  26.35 
 
 		 670 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0235  hypothetical protein  77.46 
 
 		 106 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.946889 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  24.38 
 
 		 690 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  28.48 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  25.59 
 
 		 729 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  27.94 
 
 		 624 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  29.69 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  26.35 
 
 		 624 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  45.99 
 
 		 597 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  25.4 
 
 		 626 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  25.4 
 
 		 626 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  25.4 
 
 		 626 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  24.49 
 
 		 624 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  24.9 
 
 		 624 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  40.41 
 
 		 380 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  26.29 
 
 		 660 aa  87.4  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  26.98 
 
 		 595 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  26.16 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  25.28 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  30.96 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  26.16 
 
 		 603 aa  73.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  30.54 
 
 		 606 aa  73.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  25.96 
 
 		 607 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>