More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0380 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  51.9 
 
 		 706 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  55.31 
 
 		 708 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  56.11 
 
 		 714 aa  742    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  52.9 
 
 		 685 aa  657    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  52.83 
 
 		 706 aa  663    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  100 
 
 		 713 aa  1441    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  55.54 
 
 		 709 aa  695    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  52.58 
 
 		 712 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  58.61 
 
 		 703 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  57.82 
 
 		 703 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  52.41 
 
 		 714 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  52.66 
 
 		 708 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  50.71 
 
 		 711 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  54.67 
 
 		 694 aa  713    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  59.24 
 
 		 713 aa  811    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  48.2 
 
 		 717 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  54.04 
 
 		 714 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  53.15 
 
 		 734 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  57.43 
 
 		 703 aa  771    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  52.83 
 
 		 706 aa  663    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  51.28 
 
 		 717 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  51.71 
 
 		 687 aa  622  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  51.27 
 
 		 687 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  48.46 
 
 		 696 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  51.87 
 
 		 687 aa  615  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  48.97 
 
 		 694 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  49.86 
 
 		 709 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  48.02 
 
 		 716 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  52.96 
 
 		 577 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  52.09 
 
 		 577 aa  545  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  44.37 
 
 		 723 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  44.44 
 
 		 759 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  49.12 
 
 		 582 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  48.11 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  40.2 
 
 		 726 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  41.88 
 
 		 694 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  45.23 
 
 		 536 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  39.24 
 
 		 715 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  41.33 
 
 		 528 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  35.51 
 
 		 658 aa  332  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  36.57 
 
 		 636 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  34.7 
 
 		 615 aa  300  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  35.74 
 
 		 683 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  34.84 
 
 		 688 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  34.84 
 
 		 688 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  35.41 
 
 		 681 aa  291  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  34.79 
 
 		 690 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  35.72 
 
 		 682 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  34.51 
 
 		 684 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  34.25 
 
 		 683 aa  280  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.24 
 
 		 684 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  35.44 
 
 		 679 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 645 aa  265  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  35.52 
 
 		 680 aa  264  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  35.53 
 
 		 689 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.15 
 
 		 677 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  32.33 
 
 		 654 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  34.93 
 
 		 687 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  34.23 
 
 		 687 aa  250  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  33.63 
 
 		 765 aa  250  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  32.09 
 
 		 667 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  30.58 
 
 		 751 aa  248  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  32.93 
 
 		 740 aa  248  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  34.44 
 
 		 679 aa  246  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  34.1 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  33.04 
 
 		 623 aa  234  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  48.4 
 
 		 369 aa  232  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  31.4 
 
 		 727 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  32.78 
 
 		 754 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.83 
 
 		 690 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  69.62 
 
 		 156 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  30.72 
 
 		 709 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  27.44 
 
 		 669 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.84 
 
 		 662 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  31.28 
 
 		 662 aa  191  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  67.11 
 
 		 172 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  75.63 
 
 		 129 aa  178  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  76.47 
 
 		 129 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  72.73 
 
 		 133 aa  170  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  27.15 
 
 		 652 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  27.3 
 
 		 654 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  28.4 
 
 		 670 aa  167  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  26.26 
 
 		 654 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  27.12 
 
 		 729 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  26.26 
 
 		 652 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  48.13 
 
 		 597 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  38.99 
 
 		 380 aa  151  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  35.29 
 
 		 626 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  34.8 
 
 		 624 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  34.67 
 
 		 624 aa  140  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  35.29 
 
 		 626 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  35.29 
 
 		 626 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  34.74 
 
 		 624 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  26.42 
 
 		 595 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  34.74 
 
 		 624 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  59.68 
 
 		 133 aa  134  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  35.17 
 
 		 603 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  29.17 
 
 		 660 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  35.48 
 
 		 389 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  35.38 
 
 		 607 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>