116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6194 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  100 
 
 
751 aa  1544    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  39.14 
 
 
709 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  39.72 
 
 
765 aa  363  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  36.39 
 
 
740 aa  361  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  37.07 
 
 
658 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  37.23 
 
 
727 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  36.75 
 
 
754 aa  336  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  34.43 
 
 
636 aa  318  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.89 
 
 
683 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  34.32 
 
 
689 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  35 
 
 
677 aa  303  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  33.89 
 
 
681 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  31.37 
 
 
684 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  34.32 
 
 
682 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  33.82 
 
 
690 aa  297  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  32.97 
 
 
667 aa  296  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  33.68 
 
 
683 aa  294  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  32.96 
 
 
687 aa  294  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  33.24 
 
 
684 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  34.25 
 
 
680 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  32.86 
 
 
687 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  31.49 
 
 
715 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  32.42 
 
 
688 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  32.42 
 
 
688 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  34.35 
 
 
654 aa  277  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  30.28 
 
 
714 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  33.48 
 
 
679 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  30.95 
 
 
708 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  31.26 
 
 
694 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  34.07 
 
 
679 aa  273  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  31.85 
 
 
711 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  31.34 
 
 
687 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  31.55 
 
 
726 aa  267  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  33.18 
 
 
692 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  29.93 
 
 
706 aa  266  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  29.93 
 
 
706 aa  266  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  30.59 
 
 
717 aa  264  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  31.81 
 
 
687 aa  264  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  31.32 
 
 
709 aa  264  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  31.79 
 
 
706 aa  259  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  30.9 
 
 
708 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  29.71 
 
 
714 aa  257  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  30.23 
 
 
712 aa  257  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  31.02 
 
 
685 aa  257  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  30.96 
 
 
694 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  31 
 
 
696 aa  253  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  29.32 
 
 
714 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  30.33 
 
 
713 aa  253  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  31.05 
 
 
703 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  30.09 
 
 
734 aa  252  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  30.88 
 
 
645 aa  249  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  30.58 
 
 
713 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  30.85 
 
 
687 aa  248  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  29.71 
 
 
709 aa  246  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  30.83 
 
 
615 aa  246  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  28.39 
 
 
703 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  30.12 
 
 
716 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  29.12 
 
 
694 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  27.83 
 
 
717 aa  230  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  28.65 
 
 
703 aa  230  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  30.65 
 
 
623 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  30.02 
 
 
577 aa  223  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  29.17 
 
 
546 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  28.17 
 
 
759 aa  214  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  29.24 
 
 
652 aa  211  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  29 
 
 
582 aa  210  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  29.68 
 
 
654 aa  210  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  28.1 
 
 
723 aa  210  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  28.44 
 
 
577 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  29.58 
 
 
536 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  26.26 
 
 
669 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  28.34 
 
 
652 aa  200  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.02 
 
 
654 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  27.93 
 
 
670 aa  191  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  27.27 
 
 
528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  38.81 
 
 
597 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  26.92 
 
 
690 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  26.75 
 
 
662 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  26.11 
 
 
662 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  25.11 
 
 
729 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  31.88 
 
 
380 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  29.48 
 
 
369 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  23.75 
 
 
623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  32.34 
 
 
603 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  31.8 
 
 
389 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  31.35 
 
 
606 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  31.35 
 
 
607 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  27.82 
 
 
295 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  28.8 
 
 
624 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  28.8 
 
 
624 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  29.64 
 
 
603 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0625  ParB-like nuclease  31.89 
 
 
485 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  28.12 
 
 
626 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  28.12 
 
 
626 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  28.12 
 
 
626 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  28.66 
 
 
624 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  28.12 
 
 
624 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  29.38 
 
 
595 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  27.27 
 
 
660 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  24.59 
 
 
422 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>